作者Shilia (us, together)
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标题Re: [讨论] miniPCR: A DNA Discovery System
时间Thu Nov 13 23:50:17 2014
※ 引述《ggg12345 (ggg)》之铭言：
: 谢谢您的说明.
: 这个设备怎麽看, 都看不出要耗$549才能做出来用. 比较先进的地方是那个反覆
: copy 是个有温度控制的分离, 再制. 特点是可透过手机做程序控制. 最後段是电
: 泳, 萤光标记与分析, 应该也有可能用手机对萤光照相分析才是. 类似的教学用
: 实验仪器, 台湾应该也可以做出来.
$549 已经比台制 96well 的 PCR 机器便宜很多罗（虽然这 miniPCR 没到 96well）
那说明看来应该是可透过电脑 (Windows & Mac) 和手机 (iPhone & Android) 做传
统上是在 PCR machine 上操作的程序设定。所以 miniPCR 不需要内建 Windows 作
业系统也不需要显示萤幕和触控面板或键盘，纯粹就剩下跑 PCR 的 "机器"。
照胶系统也是做成用手机就可以直接拍照存档（← 我没看到软体长怎样，但我猜应
该没特别写个 "分析" 程式，因为一般跑 PCR 就是看有没有跑出自己想要的 band，
不是拿来做定量用的 ）
$549 这价格，买一台台制的数位照胶系统都还不够喔！
是说我很久没问新机的价格了，因为 PCR machine 和数位照胶系统都是种买一次就
可以用很久的东西。
跑 PCR 温度精确很重要。翻了一下网路上的文件 (
http://goo.gl/gCT9UZ)，这台
应该有办法做 temperature gradient 去抓 PCR 需要的 annealing temp (比较古
早的 PCR 机器不见得有这功能)。对穷实验室或穷学校来说，这价格算很实惠啦！
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1F：推 jabari: 三个恒温水浴槽 + 一个大学供毒生 11/14 00:21
2F：→ jabari: 比起这个 我比较推LAMP的快速诊断 不过得请别人抓条件@@ 11/14 00:22
3F：→ Shilia: 欸我读文献时看到 LAMP 也觉得很喜欢。不过台湾有人在用 11/14 13:32
4F：→ Shilia: 这做实验吗 (就是 "有没有口碑客户的论文可以参考的" ?) 11/14 13:34
5F：→ Shilia: 因为没有机会用过的东西很难去想说要生出什麽样的改良版 11/14 13:35
6F：→ Shilia: 三个恒温水浴槽做 PCR 这件事我真的有试过喔 (我待过一间 11/14 13:37
7F：→ Shilia: 有一大堆古董设备囤积在柜子里头、又只有两个人在做实验的 11/14 13:38
8F：→ Shilia: 实验室。所以有机会尝试一堆克难又很便宜的方法做实验) 结 11/14 13:39
9F：→ Shilia: 论是如果本来就比较不好 P 的 PCR，机器都难跑了就不要为 11/14 13:40
10F：→ Shilia: 难大学工读生了 :P 11/14 13:40
11F：推 jabari: LAMP目前多为硕论...因为主要应用群是锁定需田野调查的实 11/14 14:35
12F：→ jabari: 验...不过老师们更多倾向采样回家作 11/14 14:35
13F：推 ggg12345: 请教一下为甚麽要复制2**32,才能做识别或定序? 11/14 15:01
14F：→ ggg12345: 像交大那个神研究,用啥原理对单基因体做定序?拉直比对? 11/14 15:17
15F：→ Shilia: j大：我相信 "老师们倾向采样回家做" 这一点，因为基因体 11/14 16:29
16F：→ Shilia: 医学也会有要收案的研究护理师，他们那也叫 "田野调查" 11/14 16:30
17F：→ Shilia: 抽回来的个案血液检体是医生的宝贝，可以用来做很多 GWAS 11/14 16:31
18F：→ Shilia: 还 NGS 分析，如果让学生在外头定几个基因序列定完就算了 11/14 16:32
19F：→ Shilia: 那以後就没筹码跟人家谈合作研究和挂名啦 11/14 16:33
20F：→ Shilia: g大：我猜您的问题点应该在要跑 PCR 会需要一定量的 DNA。 11/14 16:34
21F：→ Shilia: 现今台湾生医实验室最常见的做法是把 PCR 产物送去做 11/14 16:35
23F：→ Shilia: Sanger sequencing 和单细胞基因定序都需要经过 PCR 步骤 11/14 16:38
24F：→ Shilia: 所以有在发展单细胞基因定序技术的人都会知道一个双套染色 11/14 16:39
25F：→ Shilia: 体的人类细胞大概有 7pg 的染色体 DNA，mRNA 更是少於 1pg 11/14 16:41
26F：→ Shilia: 一定要先放大才足够现有的定序技术进行 Library 的制备。 11/14 16:42
27F：→ Shilia: 交大那超过物理学极限的神研究就别看了吧，真要发展单细胞 11/14 16:44
28F：→ Shilia: 基因定序技术当然是要从理论和实作技术已被接受的文献和专 11/14 16:45
29F：→ Shilia: 利念起。奠基在假 data 上是绝对不会有啥改变世界的突破的 11/14 16:47
30F：→ ggg12345: 感觉PCR反覆复制是为了定点切断,供电泳後,量够着色显影 11/15 09:43
31F：→ ggg12345: 如果交大的蛋白质电晶体让电泳排列的基因体因磁场顺排而 11/15 09:50
32F：→ ggg12345: 触发侦测出来,那是有可能不必如此多次费时反覆高量复制. 11/15 10:03
33F：→ jabari: 有梦最美 希望相随 ......... 什麽时候可以超时空warp? 11/17 20:03