作者ahot (不做乡民了)
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标题[情报] Genetics and Stat/Biostat 选校与感想
时间Sun Mar 31 03:36:35 2013
虽然我早已经不做统计了,现在做genetics and genomics做的比以前开心太多
但是在这个申请的季节,收到许多询问选校的信,还有就是我在不同领域走过的过程
以及看到以前Hopkins毕业PhD and MS的同窗的朋友这几年的遭遇
想说跟有志在这相关领域走踏的朋友分享一些我的感想
先说一下我当年申请的结果比较有一个比较基准,当年都是申请Ph.D. program
我有拿到UNC Biostatistics GRA(tuition waive plus RA position, stipend ~17k/yr)
後来在Cornell Tri-I Computational Biology and Medicine and WashU DBBS中抉择
後来选择了WashU,基本上我的领域偏向 computational biology, molecular genetics
and statistical genetics,但是在这个哪里有钱往哪走的时代,其实太多统计学家开始做
sequencing (RNA-seq, DNA-seq, Epigenome) data analysis and statistcal genetics
我也会概略讨论一下
1. Biostat/Stat PhD的学生如何选校? 先选有奖学金的,再来选择学校的好坏
有我以前的文章,里面有提及生统学校的rank,可以提供参考
请千万一定要把奖学金放在最重要的地位,有钱才去
不然PhD student的生活已经够苦了,还要缴学费跟生活费那你可能会把自己逼死唷
2. Biostat/Stat MS的学生如何选校? 选个经济实惠然後有教SAS的学校
如果是我,我会选一个便宜的学校,有提供些许奖学金的学校
如UNC, NCSU, TAMU, UC Davis, U Wisconsin-Madison, UMich 比较便宜又实惠的好学校
生活费便宜的学校,毕竟只是MS,实在没有必要去选一个好的,贵的(Hopkins, Harvard)
再给我选一次,我会选便宜的州立学校,然後生活费便宜
其实把握几个MS选校原则
1. 有教SAS, Advanced SAS
2. program duration (如果是一年半就可毕业又不用写thesis就很棒)
3. 便宜
MS毕业不是只会在一个地方找工作,所以学校的地点个人觉得不是很重要
我们一大推Hopkins Biostat ScM毕业生在全国各地找工作也没啥问题压
HR看那麽多CV不是看假的,重点是有没有以下几个字:SAS SAS SAS
想进药厂,就只有SAS就够了,想去研究机构, SAS, R, or STATA 加上你mentor好的推荐信
就够了,因为Biostat/Stat MS 就只是工具人(真的!就是那麽可悲)
但是如果你以後就打算这样下去,其实生活也很爽,程式写熟了,一下活就干完了
爽爽过,钱照领, PI也不会找你麻烦,毕竟你还是没办法那麽简单取代
但是你就只是工具人,可有可无, 所以想要有前途,请以PhD为目标
但是之後要申请PhD的话,那以上都没有用,去修好数学课再来吧
(Real Analysis, Complex Analysis, Functional Analysis)
3. ahot你为啥要换领域? (以下是个人意见)
个人觉得统计是很好的科目,好找工作,任何领域都需要统计,讲真的,拿 NIH Grant压力也
没那麽大,在WashU School of Medicine, 你想要从 Assistant Prof. to Associate Prof.
要求要有两个R01 (negotiable),在现在这年头是多困难的事情压,对於想要有生活品质还
有安逸的生活的人,statistician是很好的职业,以下是我自己换领域的理由
1. 如果你想要在stat/biostat找tenure track教职,你不是大师学生或是名校毕业的,
几乎绝缘了,毕竟统计科学领域比biomedical science小非常多,就那麽小
2. Not Scientific. Geneticists/Biologists 跟 statisticians的想法是不一样的
统计很重要,但是很多生物及医学的知识不是统计科学可以理解的,即便我觉得统计还是很
重要.想要发好paper,prediction is far from enough.George Church说过 "Why not
get your hands wet?" 他的学生及postdoc几乎都可以拿pippet做实验,等到有了data又
可以跑分析, simulation,再回到model system to validate,个人觉得一个好科学家就该
如此,懂biology,懂how to analyze your data,更重要是要与人合作
4. What's human genetics? Good program?
Genetics 太广了,我在这只讨论human genetics
human genetics通常需要运用computational/statistical methods to find targets
and then conduct functional studies to validate 所以需要跨领域的人才
如果你有biology and computer/math science double major,那就来吧等啥哩
这几年sequencing technology越来越便宜,personal medicine的时代已经不是空谈
human genetics需要的就是你这种人
通常human genetics 没有MS program (clinical genetics MS 例外)
最好的几个program如以下
Harvard (Program in Genetics and Genomics)
U of Washington in Seattle (Genome Sciences)
U of Chicago (Human Genetics)
Stanford (Genetics, Biomedical Informatics)
Johns Hopkins U (Human Genetics)
MIT (Computational and Systems Biology)
Washington University in St. Louis (Molecular Genetics and Gebomics, Human
and Statistical Genetics and Computational and System Biology)
Cornell Tri-I (Computational Biology and Medicine)
UCSF (Computational and Systems Biology)
Yale (Computational Biology and Bioinformatics)
UPenn (Genomics and Computational Biology)
Princeton (Quantitative and Computational Biology)
以後有机会再补充吧
5. 甚麽人才会成功? 不满足,不放弃,懂自己缺甚麽就去补甚麽的人有可能成功
我实在没啥资格说这些话因为我离成功还很远
但是我觉得每个人是独一无二的,不可能由别人告诉你如何成功
会成功的人知道自己需要甚麽,不满足现状
很多人到了选校的季节就开始问这个学校排名怎样压?地点好不好找工作压?好不好读压?
我只能说"人"是最重要的因素,会问以上这些问题的其实要好好问问自己自己缺乏甚麽?
你有没有成功的特质?你想要追求的是甚麽?
问题虽然都一样,但答案因人而异
个人觉得成功的要件太难列举,但是
1.请积极,不满足,追求更好
2.生活不要都是事业,家庭.生活还有朋友的关系都是成功的要件,需要经营
3.自我了解 (这是我认为西方教育跟东方教育差最多的)
4.努力
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※ 发信站: 批踢踢实业坊(ptt.cc)
◆ From: 108.216.81.224
※ 编辑: ahot 来自: 108.216.81.224 (03/31 03:46)
※ 编辑: ahot 来自: 108.216.81.224 (03/31 03:55)
※ 编辑: ahot 来自: 108.216.81.224 (03/31 03:57)
※ 编辑: ahot 来自: 108.216.81.224 (03/31 04:01)
※ 编辑: ahot 来自: 108.216.81.224 (03/31 04:02)
1F：推 scteelml:感谢分享，这对生统有兴趣又不太了解的生物人会有帮助。 03/31 04:04
2F：→ scteelml:请问SAS是指Statistical Analysis Software吗？ 03/31 04:11
3F：→ ahot:SAS refers to Statistical Analysis System,a stat software 03/31 04:15
4F：→ scteelml:您文中提到「想进药厂,就只有SAS就够了」，所以药厂在 03/31 04:17
5F：→ scteelml:招生统人时，只要会这套软体就很有机会？进药厂工作後 03/31 04:17
6F：→ scteelml:也几乎都是在用这套软体在做事吗？能否详述此点，谢谢！ 03/31 04:18
7F：→ ahot:Biostat MS level 通常工作就是处理还有分析data.SAS是FDA 03/31 04:23
8F：→ ahot:规定用的统计软体,所以药厂或是生技公司需要用SAS去执行 03/31 04:24
9F：→ bmka:Hopkins biostat有教SAS吗?据我所知没有耶,但是毕业又好找 03/31 04:55
10F：→ bmka:工作,这样不是有点自相矛盾(笑) 03/31 04:55
11F：→ bmka:FDA没有规定一定要用SAS,这是三人成虎啦,不要再乱传了 03/31 04:56
12F：→ bmka:我也不同意PhD选校原则,基本上只要是顶尖的program,进去以後 03/31 05:02
13F：→ bmka:要找RA并不难,竞争激烈的就业市场,名校光环跟有力推荐信 03/31 05:25
14F：→ bmka:只会帮你加分 03/31 05:26
15F：→ bmka:还有,你确定WashU生统教授从 assistant到associate要两个R01? 03/31 05:28
16F：→ bmka:你讲的是当PI的RO1还是只是在medical study插一脚的RO1? 03/31 05:30
17F：→ bmka:不确定的话不要乱说话 03/31 05:31
18F：→ bmka:抱歉,我应该是误解你那段有关R01的话.不过统计的RO1也很难拿 03/31 06:23
19F：→ bmka:啦,最近一堆长胜军纷纷中箭落马. 只是好学校的生统教授要找 03/31 06:24
20F：→ bmka:到足够的soft money相对比较容易,反正在每个研究计画挖一点% 03/31 06:25
21F：→ bmka:就可以养活自己了,但是经济不景气时,不是那麽顶尖学校的生统 03/31 06:26
22F：→ bmka:教授就会承受很大的压力了,结论是,还是要选择资源多的地方待 03/31 06:28
23F：→ ahot:可见bmka大没来过Hopkins读书,我们是有教SAS的,而且我也有修 03/31 07:29
24F：→ ahot:所以没有自相矛盾,我讲话是很小心谨慎的 03/31 07:30
25F：→ ahot:另外,谢谢你的资讯,FDA没有一定要用SAS,但是要去药厂就是要 03/31 07:31
26F：→ ahot:SAS,我想没啥好争论的,选校原则每个人有自己的想法,我尊重 03/31 07:32
27F：→ ahot:我说的是WashU Biomedical Sciences要升PI要两个R01,千真万确 03/31 07:34
28F：→ ahot:Biostat系上的升迁不在我的讨论范围 03/31 07:34
29F：→ ahot:bmka大太优秀了,最近很多我知道的WashU 年轻PI都要走了,感慨 03/31 07:36
30F：→ ahot:我想虽然hard money难拿,我也会试试看,之後应不会再比6%低了 03/31 07:39
31F：→ ahot:还有我选校原则关於MS部分我说过只适用之後不念PhD的学子 03/31 07:42
32F：→ ahot:只是要拿个学位去工作何必花大钱,当然要继续念要去好学校 03/31 07:43
33F：→ ahot:还有我建议的是选项UNC, NCSU这类好的州立学校,J and H 太贵 03/31 08:28
34F：→ ahot:生活费便宜,学费也比较便宜,不是说要去不好的学校但是便宜 03/31 08:28
※ 编辑: ahot 来自: 128.252.16.97 (03/31 08:30)
35F：推 qoqer:感谢你的分享 非常受用 03/31 08:51
36F：→ bmka:哪门课教SAS(好奇),据我所知Hopkins的lab以Stata跟R为主 03/31 08:55
37F：→ ahot:140.632 Introduction to the SAS Statistical Package 03/31 08:59
38F：→ bmka:坦白讲Hopkins biostat的课程设计是以PhD学生为主 03/31 09:02
39F：→ bmka:MS program的学生只是跟着上其中几门课,所以如果不是有志念 03/31 09:03
40F：→ bmka:PhD,选Hopkins读不如选有比较大MS program的学校读 03/31 09:04
41F：→ bmka:训练会比较紮实,而且比较不会觉得很挫折. 毕竟这些博士生 03/31 09:05
42F：→ bmka:都是精挑细选出来的,一起修课很难有突出表现 03/31 09:06
43F：→ bmka:不过a大,您说再让你挑一次你会选择便宜的州立大学 03/31 09:12
44F：→ bmka:但是不要忘记如果没去Hopkins您拿得到那几位大教授的推荐信吗 03/31 09:14
45F：→ bmka:很多名校出身的人似乎容易忽略自己其实占了名校光环的好处 03/31 09:17
46F：→ bmka:反正这条路还很长,加油吧 03/31 09:19
47F：→ ahot:b大点出了最重要的事情,我其实当时在读的时候非常辛苦痛苦 03/31 09:47
48F：→ ahot:所有的课程都是为PhD设计,然後又要跟Ph.D.竞争,是非常沮丧的 03/31 09:48
49F：→ ahot:我那时的老板Giovanni Parmigiani在他手下不是上天堂就是地狱 03/31 09:49
50F：→ ahot:以当时一个MS student怎麽可能取悦他?我只能说这种老板在 03/31 09:51
51F：→ ahot:Harvard and Hopkins非常多,在这两间读biostat MS真的不是最 03/31 09:52
52F：→ ahot:好的环境,後来我第一年的申请,也因为Giovanni的信导致失败 03/31 09:52
53F：→ ahot:还好Tom and Nilanjan後来的信帮助我拿到非常多好的offer 03/31 09:53
54F：→ ahot:所以你要怎麽说?所以我才说我宁可去UNC, UMich, or UMN念可能 03/31 09:54
55F：→ ahot:经济上,生活上甚至课业上对於我会是比较好的 03/31 09:55
56F：→ ahot:还是老话一句,自身经验还是去好的州立学校比较好,我相信我跟 03/31 09:56
57F：→ ahot:b大这样的讨论应该可以帮助以後要念biostat的学生选校了 03/31 09:57
58F：→ ahot:Hopkins虽然带给我光环,但是背後的羞辱,心酸不是外人知道的 03/31 09:58
59F：→ bmka:不过你的经验也导致了对生统的偏见 03/31 10:36
60F：→ bmka:旁观人来看,您应该是进了远超过自己能力的program,导致以後 03/31 10:40
61F：→ bmka:的挫折,这不是Hopkins的错(他们要的本来就是菁英中的菁英) 03/31 10:41
62F：→ bmka:当然也不是您的问题,只是当初运气太好(还是您有绿卡?) 03/31 10:43
63F：→ bmka:生统即使是PhD program也不致於要求要有complex analysis 03/31 10:44
64F：→ bmka:或functional analysis, 甚至measure theory也是进来了再修 03/31 10:45
65F：→ bmka:您应该是在Hopkins受的打击太大而会有此误解 03/31 10:46
66F：→ ahot:我想b大你的联想能力也太好,我念的是辛苦,但是我的再Hopkins 03/31 10:50
67F：→ ahot:表现从Tom, Nilanjan and Nae-Yuh的推荐信就可以知道如何 03/31 10:52
68F：→ ahot:至於Giovanni只是名义上的mentor,所以她爱惜羽毛给我的信上写 03/31 10:53
69F：→ ahot:Can not comment,如果扣掉Epi三门各三学分的必修,我biostat的 03/31 10:54
70F：→ ahot:GPA主修接近3.7而不是3.5,这个去打听打听就知道 03/31 10:55
71F：→ ahot:当初会上Hopkins确实试运气很好,但是这也是命,我也很珍惜 03/31 10:56
72F：→ ahot:另外我对biostat没啥偏见,我只是接触很多领域,陈述我的意见 03/31 10:58
73F：→ ahot:至於羞辱是这些PI对待人的方式很羞辱别人,为啥不能客客气气 03/31 11:00
74F：→ ahot:对待MS的学生,所以你不需要小题大作 03/31 11:00
75F：→ bmka:那您就多多记得那些帮过你的老师们吧 03/31 11:07
76F：→ bmka:很多时候人跟人的相处只是气场合不合的问题 03/31 11:08
77F：→ bmka:不要把跟其中一个PI相处的经验放大到整个program 03/31 11:12
78F：→ bmka:PS.Giovanni的确是自视颇高,但是听说他很挺自己的学生 :) 03/31 11:16
79F：→ ahot:我有点不解你到底是生甚麽气?我完全同意这个program是设计给 03/31 11:16
80F：→ ahot:给PhD的,说真的MS对她们可有可无,我也同意你说的去有着大MS的 03/31 11:17
81F：→ bmka:我没生气啊(摊手),您提供您的perspective,我提供我的 03/31 11:17
82F：→ ahot:学校,毕竟在那边个人觉得所受的教育品质比较好,我遇到的问题 03/31 11:18
83F：→ bmka:在这个圈子混了十几年,总是可以讲几句话吧 :) 03/31 11:18
84F：→ ahot:其他的MS有些也有遇到,我知道这个圈子很小,Hopkins的老师跟您 03/31 11:19
85F：→ ahot:很熟视,但是有时候学生的问题或是理解真的是跟老师有差距 03/31 11:20
86F：→ ahot:我从以前到现在都觉得Hopkins biostat很好很强,但是身为MS学 03/31 11:22
87F：→ ahot:生跟老师相处的过程,只有私底下学生互相讨论才会了解 03/31 11:22
88F：→ bmka:很不幸的这是MS program设计的问题,资源放在PhD program 03/31 11:31
89F：→ bmka:硕士班学生的需求就被忽略了,但是这几年应该情况又不同了 03/31 11:32
90F：→ bmka:听说现在是夸张到北大科大前两名进PhD,3-5名进MS 03/31 11:34
91F：→ bmka:所以连硕士生都超强,校方也愿意多花资源在这些学生身上 03/31 11:36
92F：→ ahot:听某admission committee的学生说过,现在是这样,太多好学生 03/31 11:37
93F：→ ahot:从北大,科大还有复旦出来了,我很开心ScM越办越好,至少我们这 03/31 11:39
94F：→ ahot:些小白鼠成就了之後越来越好的ScM program,当然她们的素质也 03/31 11:39
95F：→ ahot:比我们这几年来的好 03/31 11:40