作者abcswatch (GTO)
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标题[新闻] 昆士兰医学基因组学中心选用SGI® LiveArc® 数位化资产管理
时间Thu Aug 5 14:13:22 2010
HPC和资料中心解决方案的全球领导厂商 SGI 公司 (NASDAQ:SGI) 今天宣布,昆士兰大学
的昆士兰医学基因组学中心 (QCMG) 已选用SGI LiveArc 储存解决方案来提升其储存、管
理和处理人类癌症基因组序列资料的能力。该专案将有助於定位导致癌症的基因改变、更
深入了解这些癌症,并可望协助战胜癌症。
QCMG 选用LiveArc旨在解决大量资料追踪并与临床资讯进行关联的问题。自2010年1月部
署 LiveArc解决方案以来,QCMG已发布了2个癌症基因组序列。QCMG的目标是在今後12个
月完成30例患者基因组、转录组和表观基因组的测序,最终探明见於及导致胰腺癌和卵巢
癌的基因改变。该中心隶属於国际癌症基因组联合体 (ICGC),ICGC是一项全球性协作课
题,旨在对25,000例个体中50种不同类型人类肿瘤进行测序。
QCMG资深生物资讯学经理John Pearson表示:「QCMG选用SGI公司的 LiveArc的原因在於
该系统最适合部署Applied Biosystems公司的Bioscope生物资讯学套件。SGI公司的本土
支援程度也是其技术入选的重要因素。」
LiveArc用於管理中继资料和工作流程处理。它包括:吸纳来自11台基因组测序仪每周产
生的超过1 TB的未定位资料资产,将本地储存的资料资产复制到易於调用、可长期储存的
大学资料库中,传递原始资料并采用SGI公司的高速计算 (HPC) 和储存系统进行处理,管
理所产生的二级和三级资料集。其硬体架构由75 TB的高速暂用储存器(scratch storage
)和SGI公司用於阶层储存管理的资料迁移设施 (DMF) 组成。暂用用储存器的输入/输出
频宽效能设计为3GB/秒,并有高水准的同步输入-输出运算速率 (IOPS) 来支援分析和资
料处理应用所需的输入/输出处理水准。
SGI公司亚太及日本区总经理兼副总裁Philip Chua表示:「QCMG是南半球最大的基因组测
序设施,SGI公司独特的技术专长和产品能够为QCMG极为重要的研究带来显着的生产力优
势。采用SGI公司的LiveArc的研究组织是一个成熟的圈子,QCMG加入其中将大幅改善本身
的工作流程和研究资料追踪。」
关於 SGI公司
SGI公司是大规模丛集运算、高效能储存、HPC和资料中心可建置和服务的全球领导者。
SGI公司专注於帮助客户克服最严厉的业务及技术挑战。进一步资讯,请浏览
http://www.sgi.com.。
LiveArc是SGI公司与澳洲Arcitecta Pty. Ltd.的合作开发成果,与SGI公司的
InfiniteStorage 解决方案一起销售。
关於昆士兰医学基因组学中心
昆士兰医学基因组学中心 (QCMG) 由澳洲国立卫生与医学研究委员会 (NHMRC)、昆士兰州
政府和昆士兰大学 (UQ) 资助建立。该中心的旗舰课题是500个胰腺癌和卵巢癌的基因组
测序,该课题是国际癌症基因组联合体 (ICGC) 的组成部分。澳洲对 ICGC的承诺促成了
这座世界级测序中心的创立,该中心设在昆士兰大学的分子生物科学研究所 (IMB) 内。
QCMG目前雇用了30多位分子生物学研究科学家和生物资讯科学家,致力於医学基因组研究
。进一步资讯,请浏览www.qcmg.org。
http://www.cna.com.tw/postwrite/cvpread.aspx?ID=64303
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