作者MiddleRe (中间绿)
看板R_Language
标题Re: [问题] 安装 OpenMP 与套件 stringi
时间Tue Jul 20 03:59:53 2021
回应一下自己的文章
我最後用这篇:
https://stackoverflow.com/questions/68263165/installing-r-on-osx-big-sur-edit-and-apple-m1-for-use-with-rcpp-and-openmp
最後一个回答解决此问题
这篇的方法是立基於 R 4.1 的 ARM 版和 ARM 64 处理器的苹果电脑
如果安装了 R 4.1,R Studio 也要使用 preview 版本的
(目前是 R Studio 1.4.1725)
否则连 R Studio 都无法开启
下载完预览版的 R Studio 以後
第一步是去应用程式商店安装 Xcode
(也可以用命令:sudo xcode-select --install)
第二步是在终端机使用以下两个命令:
curl -O
https://mac.r-project.org/openmp/openmp-11.0.1-darwin20-Release.tar.gz
sudo tar fvx openmp-11.0.1-darwin20-Release.tar.gz -C /
但奇怪的是,我在解压缩这个档案是会出现奇怪的错误
这点可以见原文
我的解决方法是用内置的解压缩软体解压缩这个档案
然後会得到一个资料夹 usr,里面还有一个资料夹 local
local 里头还有两个资料夹:lib、include
到 finder,进到 /usr/local 中
分别把刚刚解压缩的 lib 与 include 两个资料夹里的东西
丢到相应的资料夹去
第三步是在终端机使用 GNU Nano 创建 Makevars 档,输入:
cd ~
mkdir .R
nano Makevars
然後贴上以下的指令:
CPPFLAGS += -Xclang -fopenmp
LDFLAGS += -lomp
接着按下键盘 Control + O
再按下 Enter
最後按下 Control + X 离开画面
第四步就是要安装 gfortran
到
https://github.com/fxcoudert/gfortran-for-macOS/releases 去
可以找到两个档案,分别是
1. gfortran-ARM-11.0-BigSur.pkg
2. gfortran-ARM-11.0-BigSur.tar.xz
前者是有图形化介面的安装档,後者就要自己解压缩
但前者会安装错位置
因为 R 4.1 装 ARM 版的话,R 是会去读 /opt/R/arm64/ 底下的档案
所以应该要把 gfortran 装到 /opt/R/arm64/ 底下才对
因此选择以 gfortran-ARM-11.0-BigSur.tar.xz 的方式来安装 gfortran
同样地,可以使用终端机命令:
cd /opt/R/arm64/
sudo mkdir gfortran
sudo tar -xzyf gfortran-ARM-11.0-BigSur.tar.xz -C /opt/R/arm64/
但此时我的电脑会报错:tar: Can't specify both -y and -z
我的解方还是如同上面的作法,即手动解压缩
会得到一个 gfortran 资料夹
把它丢进 /opt/R/arm64/ 就对了
最後一步就是清乾净原本的 data.table
然後在 Console 输入:
remove.packages("data.table")
install.packages("data.table", type = "source",
repos = "
https://Rdatatable.gitlab.io/data.table")
之後使用 data.table 会显示:
> library("data.table")
data.table 1.14.1 IN DEVELOPMENT built 2021-07-16 21:14:20 UTC; root using 4
threads (see ?getDTthreads). Latest news: r-datatable.com
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※ 发信站: 批踢踢实业坊(ptt.cc), 来自: 49.217.197.68 (台湾)
※ 文章网址: https://webptt.com/cn.aspx?n=bbs/R_Language/M.1626724798.A.3C7.html
※ 编辑: MiddleRe (49.217.197.68 台湾), 07/20/2021 05:33:38
1F:推 khaos: 有分享 推一个 07/20 08:45
2F:推 cywhale: 推 没有这样的环境实在没法试,可供以後的网友参考经验 07/20 09:36
3F:→ andrew43: 看来这改平台的阵痛期还要持继一阵子。这些毛对使用者 07/20 09:37
4F:→ andrew43: 实在不友善。 07/20 09:37
5F:→ andrew43: 有pkg可装但竟然是「陷阱」而要自己编... 07/20 09:39
6F:推 joe120519: 感谢勇者分享 08/06 11:56
7F:推 DrRd: 感恩分享,不然我之前都用单核跑XD 08/06 13:28
8F:推 DrRd: 试了还是失败,继续用单核跑… 08/07 09:35
9F:→ MiddleRe: QQ 那我也不知道为何我可以了 08/08 01:19