R_Language 板


LINE

我猜测你需要自己手动 去调整threshold!! package中的 thresh argument 似乎起不了作用!! (或是我没弄懂怎麽用... @@") auc(c(0,30,60),c(145,327,189),thresh=0) auc(c(0,30,60),c(145,327,189),thresh=145) ## 设定 thresh 没起作用!! auc(c(0,30,60),c(145,327,189)-145,thresh=0) ## 手动设定 thresh 有作用!! 下面提供参考的程式码: T=c(0,30,60) X=matrix(c(145,327,189,188,275,165,100,89,121,201,223,188),nrow=3) rownames(X) <- paste("T",1:3,sep="") colnames(X) <- paste("S",1:ncol(X),sep="") t(X) AUC = sapply(1:ncol(X),function(k){auc(c(0,30,60),X[,k]-X[1,k],thresh=0)}) AUC [1] 6120.0000 2337.1717 206.7202 537.4380 ## ## 此方法算出来的auc不知道为什麽也不精确? ## 不过误差小於 0.1 看你是否可以接受!! ## 以下提供我手动硬刻的验算程式码: ## AA=c() for(k in 1:ncol(X)){ if( min(X[,k])==X[1,k] ){ A = ( ( (X[2,]-X[1,])*(T[2]-T[1])+(X[2,]-X[1,]+X[3,]-X[1,] )*(T[2]-T[1]))/2 )[k] }else{ if( min(X[,k])==X[2,k] ){ A = ( ( T[3]-( -(X[2,]-X[1,])/( (X[3,]-X[2,])/(T[3]-T[2]) )+T[2] ) )*( X[3,]-X[1,] )/2 )[k] }else{ A = ( ( -(X[2,]-X[1,])/( (X[3,]-X[2,])/(T[3]-T[2]) )+T[2] )*( X[2,]-X[1,] )/2 )[k] } } AA[k]=A } AA [1] 6120.0000 2337.1364 206.7188 537.4286 ## ## 比较 AUC 和 AA 参考一下: ## > AUC [1] 6120.0000 2337.1717 206.7202 537.4380 > AA [1] 6120.0000 2337.1364 206.7188 537.4286 > AUC-AA [1] 9.094947e-13 3.535354e-02 1.482629e-03 9.445100e-03 ※ 引述《CKAXI (我不在...)》之铭言: : [问题类型]: : 程式谘询(我想用R 做某件事情,但是我不知道要怎麽用R 写出来) : : [软体熟悉度]: : 新手(没写过程式,R 是我的第一次) : [问题叙述]: : 我在三个时间点做了三次测验,想以第一次测验的结果为基准计算三次测验连线下 : 的面积(若第三次的结果低於第一次的结果,则面积只计算至基准线和二三次结果 : 交界处) : 我原本想使用"flux"package中的"auc"来计算,但是经过几次测试发现其中 : thresh这个argument好像怪怪的 : http://artax.karlin.mff.cuni.cz/r-help/library/flux/html/auc.html : 不知道各位有没有其它的方法可以解决原本的问题 : [程式范例]: : 资料大略会是这样,需要计算每位受试者的area under line : Subj T1(0) T2(30) T3(60) : 1 145 327 189 : 2 188 275 165 : ... : [关键字]: --



※ 发信站: 批踢踢实业坊(ptt.cc), 来自: 203.69.30.120
※ 文章网址: http://webptt.com/cn.aspx?n=bbs/R_Language/M.1399519601.A.AC2.html
1F:推 CKAXI:感谢koai大!请让我来研究一下您提供的程式码 05/08 19:46







like.gif 您可能会有兴趣的文章
icon.png[问题/行为] 猫晚上进房间会不会有憋尿问题
icon.pngRe: [闲聊] 选了错误的女孩成为魔法少女 XDDDDDDDDDD
icon.png[正妹] 瑞典 一张
icon.png[心得] EMS高领长版毛衣.墨小楼MC1002
icon.png[分享] 丹龙隔热纸GE55+33+22
icon.png[问题] 清洗洗衣机
icon.png[寻物] 窗台下的空间
icon.png[闲聊] 双极の女神1 木魔爵
icon.png[售车] 新竹 1997 march 1297cc 白色 四门
icon.png[讨论] 能从照片感受到摄影者心情吗
icon.png[狂贺] 贺贺贺贺 贺!岛村卯月!总选举NO.1
icon.png[难过] 羡慕白皮肤的女生
icon.png阅读文章
icon.png[黑特]
icon.png[问题] SBK S1安装於安全帽位置
icon.png[分享] 旧woo100绝版开箱!!
icon.pngRe: [无言] 关於小包卫生纸
icon.png[开箱] E5-2683V3 RX480Strix 快睿C1 简单测试
icon.png[心得] 苍の海贼龙 地狱 执行者16PT
icon.png[售车] 1999年Virage iO 1.8EXi
icon.png[心得] 挑战33 LV10 狮子座pt solo
icon.png[闲聊] 手把手教你不被桶之新手主购教学
icon.png[分享] Civic Type R 量产版官方照无预警流出
icon.png[售车] Golf 4 2.0 银色 自排
icon.png[出售] Graco提篮汽座(有底座)2000元诚可议
icon.png[问题] 请问补牙材质掉了还能再补吗?(台中半年内
icon.png[问题] 44th 单曲 生写竟然都给重复的啊啊!
icon.png[心得] 华南红卡/icash 核卡
icon.png[问题] 拔牙矫正这样正常吗
icon.png[赠送] 老莫高业 初业 102年版
icon.png[情报] 三大行动支付 本季掀战火
icon.png[宝宝] 博客来Amos水蜡笔5/1特价五折
icon.pngRe: [心得] 新鲜人一些面试分享
icon.png[心得] 苍の海贼龙 地狱 麒麟25PT
icon.pngRe: [闲聊] (君の名は。雷慎入) 君名二创漫画翻译
icon.pngRe: [闲聊] OGN中场影片:失踪人口局 (英文字幕)
icon.png[问题] 台湾大哥大4G讯号差
icon.png[出售] [全国]全新千寻侘草LED灯, 水草

请输入看板名称,例如:iOS站内搜寻

TOP