作者BrowningZen (BrowningZen)
看板Physics
标题[问题] 物理研究所二转化学/生化会很困难吗?
时间Wed Oct 18 15:51:49 2017
代po如题
自从大三偶尔碰到Liquid phase AFM之後就对物理方法来研究生化系统很有兴趣,目前主
要最喜欢单分子生物物理和X ray结晶学
也修了些生化相关的课像:有机,生化,蛋白质结构,蛋白组学,分子生物,生物资讯等等来副
修
反而是物理修很少,选修只有光学,硕班统力,固态,雷射跟计算物理而已
研究所的话目前首要目标是Max Planck biophysics,ETH,EPFL,TUM,Eindinburg,Gottinge
n,Heidelberg,NUS,NTU,UTokyo,
台大也很喜欢,只是化学所跟生化所似乎口味对的不多,大概也只有~3个
请问有类似经验的大大有心得吗?非常感谢
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※ 编辑: BrowningZen (202.155.194.46), 10/18/2017 15:52:48
※ 编辑: BrowningZen (202.155.194.46), 10/18/2017 15:53:52
1F：→ wohtp: Biophysics现在是超级显学，你根本不必从物理走出去也可以 10/18 16:02
2F：→ wohtp: 做你想做的东西啊 10/18 16:02
3F：→ wohtp: 虽然你多半不能借镜，有兴趣的话你可以查查Ben Simons现在 10/18 16:05
4F：→ wohtp: 都干什麽去了，就Atland & Simons的作者，当年是我很喜欢的 10/18 16:06
5F：→ wohtp: 教授 10/18 16:06
6F：→ wohtp: 喵的我也想跳过去做生物算了 XD 10/18 16:07
7F：→ BrowningZen: 谢谢w大意见,不过似乎留在物理界玩生物的人大多都是 10/18 16:19
8F：→ BrowningZen: 做光学/建模? 10/18 16:19
9F：推 KBmax: 那作Biosystem的transfer phenomena理论的呢？像是excitati 10/18 17:32
10F：→ KBmax: on energy transfer 跟 charge transfer 10/18 17:32
11F：→ sukeda: Charge transfer或exciton transfer大部分都不是物理学家 10/18 18:37
12F：→ sukeda: 在做QQ 10/18 18:37
13F：推 KBmax: 理论化学家的天下 ^^ 10/18 21:47
14F：→ KBmax: 不过我看这方面发在JCP上面的也蛮多从物理系发的欸@@ 10/18 21:47
15F：→ Eriri: 美国这麽多物理系的人做生物物理...各式各样的都有 哪有你 10/19 00:35
16F：→ Eriri: 说的都是做光学或建模 10/19 00:35
17F：→ caseypie: 你的兴趣基本上就是structural biology中有点退烧的那片 10/19 06:50
18F：→ caseypie: 现在流行的是FRET和Cryo-EM，还有谜一般的NMR 10/19 06:50
19F：→ caseypie: 喔，所谓NMR的谜是它也不算流行了，但也很难真的不流行 10/19 06:51
20F：→ caseypie: X-ray其实也是这样啦，不管怎样都需要有人长晶体 10/19 06:51
21F：→ caseypie: 但也不太可能再红起来了 10/19 06:52
22F：→ caseypie: 回到标题的问题：我和我现在的老板都是理论物理PhD 10/19 06:54
23F：→ caseypie: 但是现在在医学院生化所工作.... 10/19 06:54
24F：推 abac1230: +1 同为抢生化饭碗的物理人 :) 10/19 15:10
25F：推 bluecadence: 看看protein databank满满的蛋白质结构，就别做X-ray 10/21 10:12
26F：→ bluecadence: crystallography了吧 :p 。比较起来 Single Molecule 10/21 10:13
27F：→ bluecadence: 还比较有趣。这个时代 sequence (Genome database) 10/21 10:15
28F：→ bluecadence: 资讯爆炸，structure (PDB)资讯爆炸，但是对於 10/21 10:16
29F：→ bluecadence: sequence - structure - function 的了解还是非常有 10/21 10:17
30F：→ bluecadence: 现。如果是我，我大概比较想走 Dynamics (structure 10/21 10:17
31F：→ bluecadence: in motion, structure as a function of time)，来 10/21 10:18
32F：→ bluecadence: 填补 sequence - structure - [dynamics] - function 10/21 10:18
33F：→ bluecadence: 的空缺。不然就是走生物资讯，从一堆爆炸的资讯中找 10/21 10:19
34F：→ bluecadence: 出与生物功能的连节。Function follows form，做生物 10/21 10:20
35F：→ bluecadence: 的产生一堆function 的资讯，做篇生物物理化学的人产 10/21 10:21
36F：→ bluecadence: 生一堆form的资讯，然後中间这个连结连部起来 :p 10/21 10:21
37F：→ bluecadence: 连"不"起来 错字 10/21 10:23
38F：→ bluecadence: 非常有"限"; 做"偏"生物物理 错字。 抱歉错字很多 10/21 10:43
39F：→ caseypie: 动态资讯就是FRET会红NMR还有人要以及CryoEM兴盛的原因 10/21 10:54
40F：→ caseypie: 生物资讯也是现在的显学，不过灌水越来越困难了 10/21 10:54
41F：→ caseypie: 其实还有两个方向是台湾似乎几乎还没有人留意到的 10/21 10:55
42F：→ caseypie: 一个是无结构蛋白，另一个是无膜液状胞器 10/21 10:56
43F：→ caseypie: 这两个方向其实又是被细胞内基因调控的研究带起来的 10/21 10:57
44F：→ caseypie: 我就不知道台湾生物物理有没有在碰後转录後转译的题材了 10/21 10:58
45F：→ bluecadence: 无结构蛋白很困难因为 1. 无法结晶不能用 x-ray 2.在 10/21 11:00
46F：→ bluecadence: 溶液中无平均结构，任何光谱方法都会造成非常宽的频 10/21 11:02
47F：→ bluecadence: 宽。所以玩 binding induced structure 应该蛮好玩的 10/21 11:03
48F：→ bluecadence: 这东西很多可以讨论 结构/entropy etc.. 不过台湾没 10/21 11:04
49F：→ bluecadence: 人玩，连审计画的人都看不懂 XD 10/21 11:05
50F：→ bluecadence: 例如你如果写个想探讨 entropy 项对於 binding 的 10/21 11:14
51F：→ bluecadence: free energy 的贡献，和对 binding specificity 的影 10/21 11:15
52F：→ bluecadence: 响，就已经没人可以审了 :p 10/21 11:16
53F：→ caseypie: 这个在北美其实正流行，entropy的影响一直都有人在做啊 10/21 11:18
54F：→ caseypie: 并没有像疏水性驱动蛋白质折叠那麽老梗，但也不是没听过 10/21 11:19
55F：→ bluecadence: 在国外是老梗，在台湾没人玩 10/21 11:20
56F：→ caseypie: 现在玩结构都玩动态玩结构系纵而不是看单一静态结构 10/21 11:20
57F：→ caseypie: 也就是说北美在流行的都是你说的「很难」的东西啊.... 10/21 11:21
58F：→ bluecadence: 所以我说要玩就玩dynamics :p 10/21 11:21
59F：→ caseypie: 我不知道这方面台湾的差距到了这麽大... 10/21 11:21
60F：→ bluecadence: 台湾的资源，与资源分配状况，这会很难理解吗? 10/21 11:29
61F：→ bluecadence: 还有NMR有甚麽好谜的?一个完全能被半古典量子理论预 10/21 11:32
62F：→ bluecadence: 测的机器，再简单不过了 10/21 11:32
63F：→ bluecadence: FRET, EPR spin label实验也都是N年前的老梗不是吗? 10/21 11:35
64F：→ caseypie: 我说啦，我说的谜是指他不怎麽流行却又永远还能有新花样 10/21 11:35
65F：→ caseypie: 我也解释了，要不是最近动态研究流行起来，NMR早就死透 10/21 11:36
66F：→ bluecadence: CryoEM 也不过最近得了奖 其实也是老梗了 10/21 11:36
67F：→ caseypie: 这些技术的原理在生物物理里从来不是重点啊 10/21 11:37
68F：→ caseypie: 技术是否老梗的关键在於工程上精度能否增强以及新的应用 10/21 11:37
69F：→ bluecadence: 的确不是重点 "很难" 一直是生物系统很难 有甚麽问题 10/21 11:38
70F：→ bluecadence: 吗? 10/21 11:38
71F：→ bluecadence: structure-funtion relationship 你觉得很简单吗? 10/21 11:38
72F：→ caseypie: 上次看到有人做了Nuclear Pore Complex的CryoEM，蛮强的 10/21 11:39
73F：→ bluecadence: 搞了一堆序列结构动态与功能的连结又知道了多少? 10/21 11:40
74F：→ caseypie: 所以实验上的难度在工程方面精度和分子大小的强化 10/21 11:42
75F：→ caseypie: 还有新的可探测系统的开发 10/21 11:43
76F：→ caseypie: 理论模拟上则是进行动态系纵结构还有生化反应网络的讨论 10/21 11:44
77F：→ caseypie: 静态->动态、单一结构->结构系综、单分子->分子互动 10/21 11:45
78F：→ caseypie: 乃至於介观complex/consensate/granule的讨论 10/21 11:46
79F：→ bluecadence: 你继续帮原po上课吧 他会感激你的 :p 10/21 11:47
80F：→ caseypie: 同时用统计大数据手段去「先求结果再求原理」 10/21 11:47
81F：→ caseypie: 这些都是现在（欧美）热门的研究方向啊 10/21 11:48
82F：→ caseypie: 我就在说你说的方向没错顺便补充点东西，也没要帮谁上课 10/21 11:52
83F：→ caseypie: 多谈一点让圈外人少点误解，也许多拉一些台湾人入坑 10/21 11:54
84F：→ caseypie: 说什麽上课呢 10/21 11:54
85F：→ BrowningZen: 哇上面各位大大真的解释得很详细,真的感激不尽 10/22 18:16
86F：→ BrowningZen: 既然有人说x-ray不流行,也确定想走偏实验的结构/单 10/22 18:23
87F：→ BrowningZen: 分子,所以台湾的话目前我找了台大化学系一个有在做 10/22 18:23
88F：→ BrowningZen: 单分子生物物理的教授.德国也好像有不错的cryoEM组, 10/22 18:24
89F：→ BrowningZen: 未来也会去信问一下 10/22 18:24
90F：→ BrowningZen: 不过感觉做结构就算是做实验的,电脑能力还是要很不 10/22 18:28
91F：→ BrowningZen: 错?请问有什麽特别要先学的吗? 10/22 18:28
92F：→ bluecadence: 如果有时间玩玩 linux 吧。然後有再多的时间学个 10/23 23:06
93F：→ bluecadence: scripting language 像是 python。有再多的时间学一 10/23 23:06
94F：→ bluecadence: 下 C 。有更多的时间学一下 C++ 。 10/23 23:07
95F：→ bluecadence: 这样大概差不多了，再遇到甚麽电脑语言看一下语法就 10/23 23:09
96F：→ bluecadence: 就立刻能上手了 10/23 23:09
97F：→ bluecadence: 不过老实说 这些东西都是其次 实验做的好做的出来 才 10/23 23:14
98F：→ bluecadence: 是最重要的 其他的东西 有空无聊再玩吧 10/23 23:15
99F：推 ricoricoyan: 来台大化学 你会後悔…去国外吧……… 10/26 11:26
100F：→ sputtering: python显学耶 正在熟悉语法中 之後想做量子编程 10/27 10:43