作者mzac1b (Goodday)
看板perl
标题[问题] 请问如何随机截取一段序列?
时间Thu Mar 22 13:50:50 2007
各位大大好
小弟我最近在用perl 做氨机酸序列的分析
我学过的perl书只有 "begining perl for bioinformatics"
我想测试某个计分方式
对於 "指定的 motif"
与 "随机挑选之序列" 是否有明显的差异
请问:
如何从一群蛋白质序列 (约30000 个蛋白质序列)
由其中随机挑选出任意一个蛋白质任意一段连续的短序列 ( ~30a.a. 的短序列)
我想挑选 5000 段随机的短序列
请问这样要怎麽写
先感谢不吝赐教~~~
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◆ From: 140.109.55.227
1F:推 Andor:substr($dna, int(rand(length($dna)+1-30)), 30) 03/22 17:49
2F:推 plankton:楼上正解 XDD 03/24 00:36
3F:→ plankton:说真的我觉得 Learning perl 比 原PO说的那本书好用 03/24 00:38