作者mzac1b (Goodday)
看板perl
标题Re: [问题] 想请问一个生物资讯问题 如何找ㄧ串mo …
时间Thu May 25 16:14:50 2006
※ 引述《fuu0115 (风)》之铭言：
: ※ 引述《mzac1b (Goodday)》之铭言：
: : --------------------------------------
: : [问题]
: : 蛋白质序列 -------------motif--motif--motif--motif--motif-----------
: : 其中motif 与motif 间隔约10 个胺基酸
: : 且一个蛋白质可能不只一串motif
: : 我要取每一串的第一个motif 那要怎麽写呢 ??
: : --------------------------------------
: : 我学perl 一个多月
: : 主要看 Beginning perl for bioinformaitcs
: : 这本书只有讲用
: : $protein =~ /$motif/
: : 来找含 motif 之蛋白
: : 我听说能直接指定一串motif中我要的第n 个
: : 恳请赐教~~~~
: 直接取第一个motif
: $seq = "-----------motif--motif--motif";
: $motif = "xxx";
: print $1 if($seq =~/($motif)/) #取第一个结果并印出
: 要取第n个
: @motifs = ($seq =~/$motif/g);
: print $motif[$n-1]; #取第n个结果印出
转眼过一个月了
先感谢风大大
再请问 ^^"
取下motif 之後
如何能知道该 motif 的第一个胺基酸是
整个蛋白的第几个胺基酸??
thx a lot ~
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