作者seagal (待救的小米)
看板CSSE
标题Re: [转录]Re: [问题] Folding@home
时间Mon Apr 25 03:53:16 2005
基本上drug设计
是属於docking问题
而docking是属於NPC问题
另一个相关的问题是folding
同样也是NPC
因此用目前电脑架构
找出来的解答 都不会有多好
例如 以folding当例子
解蛋白质结构
完全使用电脑技术 不作实验的
不到全部的3%
因为会错的很惨 为什麽呢?
其中一个很简单的原因 NPC问题根本不可能找过全部的space
而药物设计就比较难统计出比例
因为绝大部分是要厂开发 因此他们不会告诉你他的开发流程是什麽
但以在学术借来看
完全以电脑模拟设计药物
大约有九成失败率 因为要考量东西太多(pathway)
加上又一堆NPC问题
而NPC问题没办法用目前电脑解
那要怎麽办呢
我有两个寄於厚望的方向
一个是大家之前讨论热烈的量子电脑
我就不多说了
第二个就是学习生物 nature方法(其实量子电脑也算是利用nature力量)
因为人脑 大自然根本不会遭遇NPC
只有人设计出来的东西才有NPC
所以直接用大自然来解
在199x年就有人拿基因序列解NPC问题 而且成功
登在top journal Science上面
过几年我在bioinformatic上面也看到antibody技术解NPC
其中更有许多大大小小篇有提到这些
有兴趣的人我可以翻出来跟大家分享
※ 引述《reader (读者)》之铭言:
: ※ [本文转录自 Biotech 看板]
: 作者: reader (读者) 看板: Biotech
: 标题: Re: [问题] Folding@home
: 时间: Thu Dec 30 15:28:41 2004
: ※ 引述《reader (读者)》之铭言:
: : 推 oplz:我有一个可能很笨的问题, 那 IBM 为甚麽不 134.174.178.197 12/30
: : → oplz:做十台 BlueGene 把他连起来变 1000 T 啊? 134.174.178.197 12/30
: IBM 是有订单才会做的, BlueGene 是美国能源部的订单,主要是因为
: 日本的 Earth Simulator 拿下世界第一,美国就很不爽,觉得这样子
: 没面子,所以能源部超级电脑中心就与 IBM 合作开发新的超级电脑。
: 这件事情就是这麽愚蠢,就是政治的关系。
: 不过 IBM 用了网格计算 (Grid Computing) 的技术,设计上可以装配
: 65536 颗 PowerPC 的 CPU, 现在只装配 16384 颗,还不是完整版的
: 系统,在明年才会完全组装出来,总共 360Tflops.
: 想当然尔,弄出 360 这个数字也是为了一个好彩头。
: 目前 BlueGene/L 已经成为 eServer 的新型号,卖出好几台了,大多
: 用来做基因研究,不过由於价钱昂贵,其他几台都没有装太多 CPU 。
: 而既然是采用网格计算的技术,理论上应该是可以外部结合多台同型
: 电脑成为更大的系统,而不必然限定在同机器上的 CPU, 只是同机器
: 可以发挥九成以上的计算能力,但不同机器却会损失大半的计算力,
: 所以短期内应该还不会有人拿大型的超级电脑来连结。
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◆ From: 140.109.73.177
※ 编辑: seagal 来自: 140.109.73.177 (04/25 03:57)