作者ETBR (SDS)
看板Biotech
标题[讨论] lambda red recombination问题
时间Sat Jan 22 00:15:09 2022
各位前辈大家好
最近尝试使用lambda red recombination剔除E.coli(BW25141)的目标基因(972 nt)
方法是将含有pKD46的E.coli 在10mM的arabinose的诱导下养至OD0.4,在用去离子水清洗後做成competent cell
之後以目标基因上下游各50nt结合pKD3 priming site位置的引子,pcr出左右端是目标基因上下游,中间是pKD3 CmR含promoter的序列(1134 nt)
在透过电穿孔将pcr产物送进competent cell後,在LB养两个小时,然後涂抹在chloramphenicol的盘子上(25 micro gram/mL),之後挑选single colony做colony pcr确认
神奇的是,不管以目标基因本身的序列或是CmR的序列来做pcr都能得到相对应大小的pcr产物,感觉是recombination错了地方,不仅目标基因没被剔除,还把CmR序列接了进去,不晓得有没有前辈有类似的经验可以分享,感谢
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1F:→ Qaaaa: 那Cm塞进去後的重组大小应该要大於原本Cm多少? 01/22 00:59
2F:→ Qaaaa: 然後也可以换一个位置塞塞看 01/22 01:00