作者Meno (今天没吃药)
看板Biotech
标题Proteome analysis 结果判断
时间Fri Aug 27 19:34:31 2021
手机排版，若不方便阅读还请见谅。
本人没有proteome的相关经验，但最近看paper时，作者给了一张 proteome analysis 的
结果，并下了 ABCB1 表现量被上调的结论 （图片如下）
https://i.imgur.com/26toU3D.jpg
ABCB1 log FC 数值是 -0.45323，我自己的理解是负的，表示表现量较低，但刚好跟作者
的结论相反，这是第一个疑惑的地方。
p-value 和 FDR 这两个没有问题，t 和 score （是Z-score吗？）代表的意义是什麽就
不太了解。
但作者除了图片上的说明外没有给额外的资讯，也无从查起如何判读，因此想询问版上是
否有人能帮我解惑。
谢谢大家！
※ 编辑: Meno (61.63.154.37 台湾), 08/27/2021 19:41:49
1F：推 qoo6032119: 是不是其实负的才是表现上升的意思呢08/28 11:45
2F：→ robbercat: log(0.1)=-1以此类推log值爲负数则Fc小於1的正数08/28 11:46
3F：→ robbercat: 举例LogX=-0.45, X=0.354808/28 11:57
非常谢谢关於数值解惑，原来是我数学不好的部分，好像能明白作者的意思了！
4F：→ xxtomnyxx: 要看作者是拿哪个样本当分母去算 FC，一般是拿控制组，08/28 21:01
5F：→ xxtomnyxx: 不过如果是拿实验组(肿瘤样本)当分母，FC 小於 1 那就08/28 21:01
6F：→ xxtomnyxx: 表示在肿瘤中是增加了。08/28 21:02
7F：推 yuasa: 既然是用Student's t，t应该是指t分布的值。P-value是从t08/28 22:27
8F：→ yuasa: 值转换而来的。Score不知。08/28 22:27
谢谢两位的回答，真的帮大忙了！！！
※ 编辑: Meno (223.136.81.200 台湾), 08/29/2021 18:08:44