作者nm768417 (opport)
看板Biotech
标题[求救] 第三代定序软体推荐
时间Wed May 19 09:51:00 2021
小弟我大学生
最近实验室开始在进行第三代定序的东西
虽然有送样本去分析
但回来的结果不太知道要怎麽处理
有推荐的软体吗
有上过网查过Pacbio的软体
但好像是用不是windows或是Mac os
所以不太清楚怎麽用
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1F：推 lelojack: 你要先说是DNA RNA Meta吧。很多工具可以做三代定序分析 05/19 12:22
2F：→ Godkin: 分析三代定序资料很简单啊~ 05/19 12:29
3F：推 july81212: terminal 05/20 13:29
4F：→ serotoninUP: 看你要做哪种分析跟哪个定序平台。但不论如何，学会L 05/21 23:30
5F：→ serotoninUP: inux会方便很多，很多软体都只能用Linux 05/21 23:30
6F：推 lelojack: 也不一定要学Linux,直上docker了啦 05/22 00:00
7F：→ nm768417: 我有用过meta G分析，但後来再把它分析出来的结果拿去bl 05/22 16:30
8F：→ nm768417: ast之後，发现没办法比对到，也就是说meta G判读出来的 05/22 16:30
9F：→ nm768417: 序列归类并不是跟NCBI上给的序列一样 05/22 16:30
10F：推 lelojack: 这样的叙述仍有不少发散的步骤，但最有可能问题是NCBI 05/23 05:41
11F：→ lelojack: 的物种资讯跟metaG用的资料库不同，你需要确认metaG用 05/23 05:41
12F：→ lelojack: 的资料库 05/23 05:41
13F：→ nm768417: 由於是比对病毒，所以我用metaG上给的ICTV的病毒资料库 05/25 17:50
14F：→ Godkin: 三代定序资料的前处理很重要 05/25 19:08
15F：→ nm768417: 那前处理的部分是要怎麽做 05/26 18:00
16F：→ Godkin: 这要看你的三代是哪家的三代罗 06/07 12:23