作者song4231 (Inequality_c)
看板Biotech
标题[求救] 药物敏感性菌株同样也有胺基酸突变
时间Thu Apr 8 16:14:09 2021
各位大大好
小妹目前正在研究临床菌株的抗药性产生原因
（以下的抗药性/敏感性菌株=对同一种药物的感受性）
原本观察到在这些抗药性菌株的胺基酸序列上A, B位点有point mutation
心想太好了总算被我找到（？
结果上次口试中被口委说到必须加入敏感性菌株做比较 否则无法确认可信度
因此小妹又加入了敏感性菌株做比较
结果发现在敏感性中A, B位点一样point mutation.....
我真是脑袋快烧掉
有问过实验室的研究助理 他说：那只好在PCR另外一段罗
基因全长1980bp 我已经P了900 在P另一半不知道会不会有很大的风险（因为必须在三个
月内赶完论文口试 但是我的临床菌株非常多）
想求救大大们有没有什麽想法可以给小妹一点指引
因为产生抗药性的原因实在太多...不知道是不是我一开始就下错方法分析了
谢谢大家（跪
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※ 编辑: song4231 (114.137.153.39 台湾), 04/08/2021 16:15:34
1F：推 monkey60391: 因为抗药性原因很多…所以你之前为什麽会觉得该基因 04/08 16:41
2F：→ monkey60391: 的point mutation是导致抗药性的原因呢？有ref可以 04/08 16:41
3F：→ monkey60391: 佐证你的假设吗？你有用未突变的基因塞回去表现看看 04/08 16:41
4F：→ monkey60391: 抗药性有没有消失吗？ 04/08 16:41
5F：→ Qaaaa: 因为这表示一开始判定的A跟B可能不是专门针对抗药性的突变 04/08 17:21
6F：推 boblu: 根据内文叙述 A 跟 B 很显然不是抗药性的成因 04/08 19:06
7F：推 boblu: 我其实不是很懂把剩下一千多base 定个序难在哪 04/08 19:09
8F：→ boblu: 现在比较会担心得的确是 抗药性的产生会不会根本跟你 04/08 19:10
9F：→ boblu: 研究的目标基因无关？ 04/08 19:10
10F：→ Qaaaa: 你可能要先看看你设定的抗生素是哪种？ 在主要抗药机制 04/08 21:42
11F：→ Qaaaa: 突变与外来plasmid中哪种的可能性会比较大 04/08 21:42
12F：→ Qaaaa: 因为你只剩三个月 其实若A/B的假设已经不成立 你需要赶快 04/08 21:43
13F：→ Qaaaa: 变更实验主题 最低限度是做类似公卫/流行病学的分析 04/08 21:44
14F：→ Qaaaa: 就是狂P 哪种已知突变或plasmid最多种 04/08 21:45
15F：→ Qaaaa: 然後看看你手头上的菌株资料 如分离年份与菌种 能否看出 04/08 21:47
16F：→ Qaaaa: 一些分布上的差异然後做统计 04/08 21:48
17F：推 Qaaaa: 3当然外来基因也有可能不见得是plasmid但总归要找个主题 04/08 21:51
18F：→ Qaaaa: 如果仍然是要做抗药性机制 然後要筛全新未知突变点 04/08 21:53
19F：→ Qaaaa: 那就不能只做一个基因而已了 可能要NGS 但你时间与实验室预 04/08 21:54
20F：→ Qaaaa: 算可能不及 04/08 21:54
21F：→ Qaaaa: 你需要跟老板好好讨论一下 最後三个月能冲些什麽方向 04/08 21:55
22F：→ xxtomnyxx: 只能说，你没有验证过A、B位点的突变就是导致抗药性这 04/09 02:39
23F：→ xxtomnyxx: 点，真的是太天真了.....至少也该把基因clone出来，把 04/09 02:40
24F：→ xxtomnyxx: 突变修好後换回去之类的方法验证过A、B突变对抗药性的 04/09 02:41
25F：→ xxtomnyxx: 影响，单单只是看到有突变就认定是该突变的影响，你做 04/09 02:41
26F：→ xxtomnyxx: 研究会有很大的问题.... 04/09 02:41