作者ChenJhih (ChenJhih)
看板Biotech
标题牛的RNA Variant DNA Varient
时间Tue May 14 22:44:10 2019
https://i.imgur.com/TKvOota.jpg
小弟最近在研究牛的基因，想知道如何从e!semble这个网站获得RNA Variant、DNA Varie
nt。（目前只知道上图的T/C是RNA Variant ...)
麻烦各位大神指点
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1F：→ Ianthegood: 有看到上面有一个tab写help & docs吗? 那个点下去 05/14 22:52
2F：→ blence: 你搞错了，给的附图是DNA variant阿 05/14 23:02
3F：→ ChenJhih: 我一开始认为是DNA variant，不过传mail问journal作者 05/15 08:20
4F：→ ChenJhih: 跟我说是RNA variant... 05/15 08:20
5F：推 lelojack: VCF:29ꂠ46165505ꂠrs42194371ꂠTꂠC，这代表是染色体29 05/15 13:01
6F：推 lelojack: VCF:29 46165505 rs42194371 T C这是代表染色体29号的 05/15 13:03
7F：→ lelojack: 位置，染色体只有一个方向，所以是DNA变异 05/15 13:03
8F：→ ChenJhih: 感谢各位的回答，我要去嘴炮论文作者了（开玩笑） 05/15 15:41
10F：→ ChenJhih: 讲的同样是上图，想请大神求助... 05/16 07:36
11F：推 lelojack: 你们真的是照SNP id在讨论吗？ 没有前後文没法判断教授 05/16 08:12
12F：→ lelojack: 是不是有误解，建议你去找生资夥伴讨论细节 05/16 08:12
13F：→ xxtomnyxx: 呃....我记得 DNA variant 和 RNA variant 概念上是不 05/16 10:52
14F：→ xxtomnyxx: 一样的东西，因为 RNA 是以 DNA 为模板做出来的，所以 05/16 10:52
15F：→ xxtomnyxx: DNA variant 会直接反应在 RNA 上(如果这个 DNA varian 05/16 10:53
16F：→ xxtomnyxx: t 位於会做出 RNA 的序列上)；RNA variant 应该是指在 05/16 10:54
17F：→ xxtomnyxx: transcription 时，由不同的TSS、alternative splicing 05/16 10:56
18F：→ xxtomnyxx: 或使用不同 polyA signal 而产生不同的 RNA 产物，这无 05/16 10:57
19F：→ xxtomnyxx: 官 DNA 序列有无不同都会产生，虽然 DNA variant可能影 05/16 10:58
20F：→ xxtomnyxx: 响能产生哪些 RNA variant，但他们概念上应该是不同的 05/16 10:59
21F：推 lelojack: 网站中已经有写到RNA变异NSBTAT00000068819.1:c.*1324A> 05/16 13:38
22F：→ lelojack: G，我猜是认知不同造成的差异 05/16 13:38