作者jming (PETER J)
看板Biotech
标题[求救] 16smetagenomcis与培养法的结果不同?
时间Tue Jul 3 10:42:26 2018
发问时请注意,若是要问实验相关的问题,请将实验的步骤、所用的条件大致列出
以方便板友帮您追踪问题
若是求救事项涉及实验室智慧财产(例如细胞细菌植株、质体载体等)之分让,
请务必注明贵实验室愿意设立 正式合作或 签署材料分让协议(MTA),否则版工将迳行删除
----请将上列注意事项以 ctrl + k 删除後开始编辑文章----
请教各位学长姐,在环境采样後进行微生物培养与菌种监定及16S rRNA metagenomics
的分析後,结果发现培养法中CONS分离最多,但在metagenomics结果分析上以不动杆菌属
最为丰富.造成这样结果如何解释?
培养法与16S rRNA metagenomics结果不同地方在哪?
我知道培养法能分离出活菌种,但有99%以上的环境菌无法培养
metagenomics是可以分析培养法无法分离培养的菌
谢谢
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1F:→ Ianthegood: 所有的培养都是enrichment 只有喜欢你的培养环境的会 07/03 15:14
2F:→ Ianthegood: 长 07/03 15:14
3F:→ owl9813: 结果不同的地方是指什麽?请表达清楚 07/06 09:14
4F:→ jming: 我培养法培养出Cons菌种最多 07/06 21:57
5F:→ jming: 但在16s metagenmic葡萄球菌属不是很丰富 07/06 21:58
6F:推 sisley: 活菌死菌的差异也会有影响,NGS死活都看,培养法只看活菌 07/12 12:01