作者Shalexx (啃琳)
看板Biotech
标题[求救] primer predict
时间Fri Jun 15 16:21:24 2018
------我是菜逼八硕一如果提出很菜的问题可以骂但请各位大大骂完还是能帮个忙解答--
------
最近在尝试把一只放线菌的ori用pcr的方式挑出来，但设计出来的primer F会乱黏，所以
要重新设计primer。
教授要我设计完去predict看看primer会不会再乱黏（上次忘记先predict），想请教各位
大大整个放线菌genome大概三百万mer（超大），有没有什麽软体是适合这麽大的genome
。
--
※ 发信站: 批踢踢实业坊(ptt.cc), 来自: 223.141.78.232
※ 文章网址: https://webptt.com/cn.aspx?n=bbs/Biotech/M.1529050886.A.CDA.html
1F：→ xxtomnyxx: NCBI primer BLAST 系统就可以做了，不过我不知道 NCBI 06/15 18:22
2F：→ xxtomnyxx: 有没有 Actinobacteria 的 genome sequence 06/15 18:23
3F：→ Shalexx: 谢谢~~~ 06/16 00:06
4F：→ Shalexx: NCBI都只有片段 这也是个问题 06/16 00:07
5F：→ supray: 提醒一下 看专一性primer blast不用自己贴Template 06/16 01:28
6F：→ supray: 底下物种选对 整个genome就帮你比对了 06/16 01:29
7F：→ supray: 放射菌属的genome有喔 但只能比nr资料库 06/16 01:30
8F：→ Shalexx: 好的~~~谢谢 06/16 16:40