作者yp1369 ()
看板Biotech
标题[求救] Gene id 类型
时间Wed Apr 25 16:24:48 2018
各位大大好，小弟刚跨入生物资讯领域，
在看一个enhancer-gene interaction资料库时，
不是很清楚其中的gene id栏位为何，
http://enhanceratlas.org/download.php
其内容大致如下：
chrX 153597160 153598700 91814 chrX 153607985 ENST00000492448 ...
chr1 1499170 1500150 116 chr1 1243947 ENST00000379031 ...
有找到栏位说明：
http://enhanceratlas.org/Data_format_EP.txt
对於第4栏的id，试着用NCBI id查询但对应不到，
不知道是否enhancer有常用的id表示?
感谢！
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1F：推 lelojack: Gene ID - A number taken as the gene id @@ 04/25 21:55
2F：→ lelojack: 我测试过 应该不是常用的资料库而且说明写得很暧昧 04/25 21:56
3F：→ lelojack: 建议用後面ensembl Transcript id来对基因名称 04/25 21:57
4F：→ yp1369: 好喔！感谢 04/26 00:31