作者keroromoa (夏天一到就凸显自己很鲁)
看板Biotech
标题[求救] DNA annotation相关软体
时间Mon Jul 17 17:07:02 2017
小弟刚踏入dry lab没多久,
老师在和我聊过後认为我需要优先培养dry lab相关的sense,
目前小弟的计画是关於建立与整合mutation sequence database,
并进行annotation相关的工作。
在这里想请教各位熟悉大数据相关annotation的前辈,
想要寻找能够一次进行数千笔甚至数万笔以上sequence的annotation相关的软体,
要从什麽方向或关键字切入寻找(以提供在linux上进行的open source为主)?
目前从PubMed一些review paper看到的资料大都像blast系统一样,
一次只能input几个sequence。
谢谢~
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※ 发信站: 批踢踢实业坊(ptt.cc), 来自: 163.25.93.81
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※ keroromoa:转录至看板 BioMedInfo 07/17 17:13
1F:推 lelojack: 请问什麽物种呢????人的就蛮无聊工具都写好好的 07/17 18:36
3F:→ lelojack: a/Genomics.htm 07/17 18:43
4F:→ Ianthegood: blast2go? 07/17 19:50