作者silverberry (平行线上的交集....)
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标题Re: [求救] 请教制作stable clone cell line花的时间
时间Wed Jun 8 14:34:01 2016
原文恕删 m(_ _)m
第一次发长文,排版不良请见谅。
刚好过去有建立 stable clone cell line 的经验,
在这里跟大家分享。
---------我是分隔线---------
目前常用的病毒转染系统有
retro,
lenti,
adeno,
adeno-associated virus
各有优劣和适用范围,可以搭配实验室的需求挑选 (1)。
厂商 Clontehc 有详细的比较 (2)
http://goo.gl/cVecku
简单来说,可就三大部分考虑
host
虽然这些病毒系统的感染效率都不错,但是总是会遇到一两个难搞的 host cell line。
另一个关键是 host cell 会不会分裂,这与病毒感染机制有关。
genome integration
载体/外源基因嵌入 host genome,虽然相对於以 episome 形式来说,
更能确认不会在细胞复制过程中消失。
但是嵌入 host genome 的位置可能会影响 host 本身的特性;
或是受到 host genomic DNA epigenetic modification 的影响改变外源基因的表现。
transgene property
几个?多大?表现量要多高?
不同的病毒载体有不同的特性,载体设计也可以增加自由度。
配合实验室需求,挑选最适的系统可以减少额外的变因。
在这里 (因为个人偏见) 以
lentivirus system 为主 (3)。
流程大概可以简化为
virus packaging →
infection host cells →
selection
virus packaging
合适的 HEK293T cell 作为 virus packaging 的 host。
不加准备 packaging vector 的准备时间,
被转染的 HEK 293T cell 可以在 48-72 h 把 lentivirus 做出来。
新鲜的 lentivirus 可以直接感染 host cell,或是分装冷冻在 -80 备用 (4)。
infection host cells
把 lentivirus 病毒液加到 host cell 培养基中。
理论上 24 h 就可以观察到外源基因的表现。
有时病毒对 host 太毒,host 会病恹恹的。
感染条件稍微微调一下,host 在去除病毒液之後,都会慢慢好转。
selection
常见的 drug selection 的 killing curve 漂亮的话,drug 筛选效果都不会太差。
用 GFP/RFP 等等的 reporter,用 FACS 筛选也很方便。
一切都是配合实验室的设备和後续实验的需求。
时程和工作量上,stable pool 和 stable clone 会差很多。
主要是 single cloning 的效率和工作量。
参考厂商的网页
http://goo.gl/ykbfzm
虽然这张图是 CRISPR 的流程,感染两次 lentivirus。
不过一个 stable pool 和 clone 大概就是 2 周和 6 周的差别。
(当然是指一切就绪顺利的情况下~)
到这里为止,差不多就有想要的 cell line 可以继续做研究了 (5)。
备注
(1) 因为 iPS 很红的
sendai virus 没被列入讨论。
(2) 有不少厂商都有卖这些系统。学校里花小钱建立系统的方法也有很多~
(3) 未来 CAR-T 都可以打进人体了,lenti 系统 (对操作者) 的安全性应该 ok~
(4) 新鲜的病毒液配合需求尽快进行浓缩、纯化、定量,4 度暂存的时间越短越好。
(5) 如果担心细胞株稳定性,可能还要做一些稳定性测试等等,或是监定嵌入位点。
---------我是分隔线---------
感谢收看 m(_ _)m
当初进入这个领域时,受到版友大大们的照顾。
以这篇 "心得文" 再次感谢领进门的版友师傅们。
也希望可以大家可以一起分享心得~
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※ 文章网址: https://webptt.com/cn.aspx?n=bbs/Biotech/M.1465367650.A.857.html
1F:→ silverberry: 第一个网址 06/08 14:34
2F:→ silverberry: Clontech -> Products > Viral_Transduction > 06/08 14:36
3F:→ silverberry: Selection_Guides > Comparison_of_Viral_Systems 06/08 14:37
4F:→ silverberry: 第二个网址 06/08 14:37
5F:→ silverberry: google "dharmacon lentivirus stable cell line" 06/08 14:40
6F:→ silverberry: 第一张图就是了 06/08 14:40
7F:→ milkpa: 应该是293"T"细胞吧 06/08 15:57
8F:推 aceliang: 应该没有人拿HEK293来package病毒呗~ 06/08 16:07
9F:→ milkpa: 虽然用293不是不行,但产量应该是有差的 06/08 16:08
10F:→ Ice9: 网址找地方缩一缩再贴上行不通吗? 06/09 05:06
13F:→ jabari: 感觉CRISPR/Cas9真的是好恐怖的工具 千钧一发要来了吗? 06/11 16:11
※ 编辑: silverberry (36.225.44.195), 06/12/2016 18:14:13
14F:→ silverberry: 已改 HEK293T。 06/12 18:14
15F:→ silverberry: 因为我们实验室之前不是做这块的。所以 HEK293 cell 06/12 18:15
16F:→ silverberry: 是跟别的实验室要来的。大家的标示都不太清楚 Orz 06/12 18:15
17F:→ silverberry: 我还用过一株 HEK293FT,因为 passage number 很低 06/12 18:16
18F:→ silverberry: 和另外一支标示 HEK293 低代数的效价都很好, 06/12 18:16
19F:→ silverberry: 这个部分还请大家分享~ 06/12 18:17
20F:→ silverberry: 我一开始用 ppt 短网址,post 被说是广告 @ @ 06/12 18:17
※ 编辑: silverberry (36.225.44.195), 06/12/2016 18:18:55
21F:→ silverberry: 感谢 ja 大的缩网址~文章已修改。 06/12 18:19