作者stevekevin10 (hippo泡)
看板Biotech
标题[讨论] CDNA上生物标记
时间Thu Jul 9 17:26:59 2015
在查资料时
发现生物标记大多在dna上做
为何不在cdna上做呢?
有没有相关的文章或是讨论可看看
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1F：→ blence: 细胞内有cDNA可以做生物标记吗07/09 18:31
2F：→ stevekevin10: 是没有 不过萃取出CDNA再来找其上的功能或疾病类片07/09 19:16
3F：→ stevekevin10: 段标记没有意义吗?07/09 19:16
4F：→ blence: 若细胞内没有cDNA,何来萃取出cDNA呢?07/09 19:22
5F：推 vetvet: 如果是要找疾病相关的基因片段，用NGS就好了！效率快07/09 20:44
6F：→ vetvet: 很多，说不定还比较省钱07/09 20:44
7F：→ stevekevin10: 呃 mRNA自己转? 还是我搞错cDNA 不是不含intron的07/09 20:45
8F：→ stevekevin10: 转录体吗..抱歉我对这没有很熟07/09 20:45
9F：推 mesenchymal: 应该说凭你的目的来决定方法07/09 22:44
10F：→ a90648: 转cDNA需要的anzyme你确定一般细胞有?!07/09 22:58
11F：→ stevekevin10: 恩...所以没有用处吗..? 因为实验想做这个 可是不确07/09 23:13
12F：→ stevekevin10: 定在cdna上找到底有没有用处所以上来问问看07/09 23:13
13F：→ ljii: ....你要不要先讲清楚你打算怎麽作 病人检体去分析?那是没07/10 07:38
14F：→ ljii: 有"天然"CDNA的, 你可以抽total RNA後作microarray那就是07/10 07:39
15F：→ ljii: 你所谓的cDNA分析, 不过这年头RNA-seq更夯07/10 07:39
我不清楚 找到後可以干嘛..
我的状况是 本身实验室在研究找生物标记的方法 (资工) 可是有些品种只有转录体的资
料库 因此在想在转录体上找是否有意义..
16F：→ Ice9: mRNA 才是细胞内不含 intron 的转录体。07/10 08:00
抱歉 我後来去查清楚 用懂了 谢提醒
17F：→ Ianthegood: 为什麽要在mRNA上做呢 意义是什麽07/10 13:50
不知道..所以想来问问看有没有意义或是为什麽无意义:(
※ 编辑: stevekevin10 (36.224.116.20), 07/10/2015 16:54:12
18F：→ blence: 我觉得一开始问题没说清楚也没用对关键字,回答只能用猜的 07/10 17:07
19F：→ blence: 你的"转录体"可能是exome或cds之类的序列,但都还是在讲DNA 07/10 17:11
您是指 我指的转录体资料库吗
※ 编辑: stevekevin10 (36.224.116.20), 07/10/2015 17:12:11
20F：→ Ice9: 你可能需要面对面地和生物人谈论一下。另外，选 DNA 而不选 07/12 07:10
21F：→ Ice9: 其他生物体内的转录资讯，一来可能是因为转录资讯的多型性， 07/12 07:11
22F：→ Ice9: 二是转录体本身"半哀期"短而量又经常变化，三是样品稳定度 07/12 07:13
23F：→ supray: 如果是SNP或indel当生物标记,在DNA上不会遇到表现问题 07/12 09:10
24F：→ supray: 你要看的没表现的话,用RNA或cDNA就看不到了 07/12 09:11
25F：→ supray: 如果是特异性表现的基因当作生物标记,如癌症相关的生长 07/12 09:13
26F：→ supray: 因子,那用cDNA做看表现量,或用蛋白质做都有 07/12 09:14