作者mosquito355 (bigwu)
看板Biotech
标题[求救] TF search的网站不能用了
时间Fri Mar 20 13:26:00 2015
之前实验室习惯用TF search这个网页
预测特定promoter序列上的 transcription factor binding site
可是这一个礼拜想要用的时候发现网页挂掉了T_T
请问版上的大家有没有类似的网站可以推荐的呢?
就是把序列贴上去
能帮忙列出那些位置可以被那些TF结合
以及个位置被TF结合可能性的机率的工具
谢谢各位!
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※ 发信站: 批踢踢实业坊(ptt.cc), 来自: 203.71.94.8
※ 文章网址: https://webptt.com/cn.aspx?n=bbs/Biotech/M.1426829162.A.077.html
1F：→ e104582001: promo 03/20 17:22
2F：→ e104582001: ALGGEN - PROMO 03/20 17:22
3F：→ xiphos: TESS 03/20 17:29
4F：→ lail: TESS不行用了，但TF search晚上开网页还打得开啊，不过我没 03/21 00:12
5F：→ lail: 有丢序列搜寻便是 03/21 00:12
6F：→ blence: 我同时用promo, motifmap, UCSC ENCODE,特色各有不同 03/21 00:19
7F：推 bee921: 我当年是用Genomatix 还不错！ 03/21 03:08
8F：→ mosquito355: TF search的确打的开,可是丢序列进去分析跳出的网页 03/21 22:37
9F：→ mosquito355: 是404 not found~然後我用promo查到了!感谢楼上各位! 03/21 22:38