作者tirecake (Allo le monde)
看板Biotech
标题[求救] MboII 限制酶切CYP1A2*2 SNP
时间Sat Nov 9 02:30:53 2013
各位科学家大家好
我们班上实验课最近在测班上同学的CYP1A2是否有SNP "CYP1A2*2"(63C>G)
做PCR夹出含有SNP片段之後 用MboII切
查到MboII切 5'GAAGANNNNNNNN 3'
^
3'CTTCTNNNNNNN 5'
想请问
1) 那些N是什麽意思 我以为限制酶要找对的序列切 要很精准? N不管是啥都会切罗?
2) 我们要找的SNP是C>G, 但63是从哪里算起，毕竟我们primer夹出201base pair
如果有突变成G 会切成122+79
跑胶之後 发现大家都是G/G (homozygous突变!!) 各文献显示63C>G很罕见啊
怎会全班都突变哩
是不是我有误解哪部分的资讯
我有想把primer序列打到NCBI去看夹出来的片段 但是我还是不知道63是从哪里算起
这片段里也有可能有很多C
1-不确定human CYP1A2 accession number
2-我贴了整段CYP1A2序列(NCBI跟Primer3) 但我们用的primer却夹不到片段???
(後来primer3夹到了...但是不知道怎麽使用来检查班上的突变?)
3-其实我们同时有夹另一段有SNP CYP1A2*1F (-164A>C) 负的位置是指promoter吗
我是不是要去找exon intron structure有帮助呢?
还要请大家帮我找我查资料的方式错在哪
谢谢你们
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※ 发信站: 批踢踢实业坊(ptt.cc)
◆ From: 31.220.200.9
※ 编辑: tirecake 来自: 31.220.200.9 (11/09 02:33)
※ 编辑: tirecake 来自: 31.220.200.9 (11/09 02:41)
1F：→ blence:高中生？ 大学生？ 这些是paper或老师给的？ 11/09 02:41
2F：→ tirecake:真惭愧 我们是硕班 primer是老师提供的 SNP资讯文献很多 11/09 02:50
3F：→ tirecake:要用MboII切也是课程设计 不是我们想出来的 11/09 02:51
※ 编辑: tirecake 来自: 31.220.200.9 (11/09 03:01)