作者planter (黑洞)
看板Biotech
标题[求救] 有人用过miREADER软体找 novel miRNA吗
时间Wed Aug 7 00:24:59 2013
哈罗大家好
我最近看了一篇pape说他们的软体可以不用基因体全定序或transcriptome
只凭small RNA deep sequencing就可以预测novel RNA
PLoS One. 2013 Jun 21;8(6):e66857. Print 2013.
miReader: Discovering Novel miRNAs in Species without Sequenced Genome.
他们的网站还有提供下载和简单的教学
http://scbb.ihbt.res.in/2810-12/miReader.php
由於我手上没data
所以利用教学中提到的档案逐步做练习
input调miReader_dicot.jar
output随便设一个资料夹在桌面
number of processors(应该是处理器的数目)输入1跟2都试过
参考物种选阿拉伯芥
结果怎麽跑目标资料夹都是空的，而且进度都直接100%，像没跑一样。
所以想上来问问看有没有用过的学长姊们可以分享一下用吗
谢谢大家
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如果我们要把磁铁棒放进线圈，
线圈会说「不!!不要过来!!」而发出阻力不让磁铁棒靠近。
但是如果我们要把放进去的磁铁棒从线圈拿走， 「傲娇是一种
线圈反而会说「我…我又没有叫你走!!」而发出阻力不让磁铁棒离开。 自然现象」
这种现象不就是傲娇吗！ 新科科人杂志
所以傲娇这东西根本不是新梗，19世纪就有科学家发现傲娇了。 ／民明书房
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※ 发信站: 批踢踢实业坊(ptt.cc)
◆ From: 140.112.52.104
1F：推 lingon:六月底的paper应该还没什麽人注意到吧,但这个claim也有点玄 08/07 05:27
※ planter:转录至看板 BioMedInfo 08/07 17:03
2F：→ soom:我猜input是错的吧 感觉input应该是吃fastq或fasta 08/07 20:39
3F：→ soom:另外有什麽错误讯息跑出来吗? 08/07 20:40
4F：→ planter:没有错误的讯息耶 这程式不太防呆 08/08 16:07
5F：→ planter:嗯对啊 网页也说支援档案格式是fasta 但教学却没注明 08/08 16:11
6F：→ planter:我再试试java阪本的问题好了 08/08 16:11