作者puec2 ( .＿＿＿＿＿＿＿＿＿＿.)
看板Biotech
标题Re: [求救] 钓出全长序列，未知基因
时间Wed Jun 5 11:31:30 2013
※ 引述《EDONIS (ED)》之铭言：
: 请问由於用cDNA library的方法 CLONE到一段序列
: 是片段序列，老师希望我能把这序列的全长拿到!!
: 在去比对看是甚麽。请问这能RACE的方法来做吗??
: 还是??
假设你找到的东西在Genebank上面没有
那你可以...
1. 丢BLAST找最接近的基因(总不可能是你排骨开天第一人吧)
2. 用找到的已知基因去做BLAST後 取最接近的前十个hit做multiple alignment
3. 找到conserved region(总不能可能你是排骨开天第一人吧)
4. 从 conserved region设计primer 如果conserved region不够长就设计
degenerate primer primer的3' 最好是放在conserved region上面
5. PCR, TA cloning, sequencing
6. RACE有点麻烦 其实不用这麽麻烦的
--
※ 发信站: 批踢踢实业坊(ptt.cc)
◆ From: 211.76.175.170