作者lucky1300 (会死人的高跟鞋)
看板Biotech
标题[求救] Transformation 超级怪囧
时间Wed Apr 24 21:19:23 2013
前情提要:
目前手上正在接一个 vector 9.6K/insert 1.5K 的construct
vector使用割胶回收取得
inster使用PCR取得
以molar ratio I:V=3:1 的量
使用T4 ligase室温作用3小时後转到JM109
heat shock後涂抹在LB+Amp的固体培养基
o/n之後 培养基上有长出菌落 (我有作vector only的培养基 没有长)
挑将近10个菌落作colony PCR(同时也有另外涂一盘保留,以下称plate-B)
primer一条使用vector上的 一条使用insert上的
跑胶後在
正确的位置上有出现明显条带
-----问题开始---------------------------------------------------
为了再次确认是否得到正确construct
我挑了Plate-B上的菌落 用liquid LB+Amp养小量
想抽plasmid 再用限制酵素去切确认片段大小
奇怪的是
我Plate-B上的菌落丢到liquid LB+Amp 12个小时之後什麽都没长
再挑几个菌落去作也是一样什麽都没长出来
我确定我
液态跟固态培养基所使用的Amp浓度是一样的
(而我同时也有进行另一个construct 使用同一罐液态培养基结果很正常)
因此还烦请版上有经验的朋友多多给我意见
我还不想放弃这次的结果Q_Q
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礼貌欧 ▼ ┴─┴
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◆ From: 118.168.64.47
1F:→ blence:同时涂两盘,为什麽会觉得plate-B是杂菌... 04/24 21:33
请问同时涂两盘的意思是?虽然我也不觉得plate-B是杂菌XD
2F:→ sylvialalala:我的clony pcr第一次check很多都有false-positive的 04/24 22:07
3F:→ sylvialalala:band..我建议你可以重用第一次p出来的primer再 04/24 22:08
4F:→ sylvialalala:p plate-b的菌落,这样就知道plate-b上的还是不是你要 04/24 22:08
如果是false-positive band的话 养菌是不是应该还是可以长得起来?
但後续用酵素确认会切不到正确的大小这样
另外也非常非常感谢您的建议 我明天再试试看!
※ 编辑: lucky1300 来自: 118.168.64.47 (04/24 22:21)
5F:推 TOTO:V:I=3:1? 正常不是应该是1:3 04/24 22:18
嗯嗯是的 感谢提醒一时打太快没注意!
※ 编辑: lucky1300 来自: 118.168.64.47 (04/24 22:27)
6F:→ blence:原po不是说涂一盘挑c-PCR,另一盘为plate-B,不是同时涂两盘? 04/24 22:28
7F:→ blence:有些不见得是原因,不过你这case不该用JM109,对plasmid>6k容 04/24 22:29
8F:→ blence:易不好,许多操作手册会写,另外大plasmid或有recombination 04/24 22:30
9F:→ blence:用c-PCR想必容易false 04/24 22:31
我作的顺序是用tip从原始那盘挑一个菌 在另外一盘(plate-B)划一道
再来就直接在加好PCR药剂的tube里搅一搅这样 不好意思没有讲清楚
我之前有接过几个大於10K的plasmid 因为JM109用得顺手所以就一直使用也没去看手册囧
非常非常感谢B大的提醒 :)
※ 编辑: lucky1300 来自: 118.168.64.47 (04/24 22:36)
10F:→ blence:再确认此cloning问题是源自vector,还是该insert在其他Vecto 04/24 22:32
11F:→ blence:也会,如果是後者,就不适合用该vector惯用方式处理 04/24 22:34
12F:→ blence:我有几个大contruct送进Ecoil长的起来,但只要把plate或mini 04/24 22:36
13F:→ blence:冰箱,要嘛长不好(6h看到有浊,12h却澄清死光光),也常空包弹 04/24 22:37
从大家过去的经验我猜应该是vector的影响比较大
那我会再去看看原始的vector是被转到哪个菌里
非常感谢您的热心!
※ 编辑: lucky1300 来自: 118.168.64.47 (04/24 22:44)
※ 编辑: lucky1300 来自: 118.168.64.47 (04/24 22:45)
14F:→ storm780121:PCR有摆negative control吗? 04/25 13:44
15F:→ pianostar:这麽大的plasmid 用电的也许成功率会高很多吧? 04/30 09:05
16F:→ pianostar:菌养不出来 可以养个抗amp的ecoli 做control 排除器材 04/30 09:06