作者fvf (TAR TAR)
看板Biotech
标题[求救] High Range DNA Ladder
时间Thu Apr 4 23:14:15 2013
第一次在此板发文,文似乎有点长
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自从Clone了大小有15kb之谱的质体成功之後
就跟老板请求订购可以订出10kb以上的DNA marker
订的是「Thermo GeneRuler High Range DNA Ladder」
一直以来实验室都只有用过1kb、100bp的DNA marker
因为两种marker的用法大同小异(1kb用1% agarose gel、100bp用2% agarose gel)
当High Range DNA Ladder送来的时候,他是需要自行添加6X loadding dye的
而说明书上也有建议的比例配法,而使用的Gel也建议0.4%
因为制胶台有限,怕会混淆其他人使用,所以先使用了1% gel下去跑100V,1hr左右
结果跑出来发现Marker并没有被跑开,整个是混在一起的
(有以1kb下去做对照,1kb是成功跑开了)
之後只好配置一批0.4%的Gel再跑一次100V,1hr,还是无法跑开
之後试过用了50V去跑1hr,结果是一样的
在此提供一下说明书上的建议
「1X TAE」、「0.4%(low percentage) agarose gel」
「3V/cm 1.5h」、「0.4ug/lane」、「8cm length gel」
我们实验室用的一直是1X TAE、0.4% Gel有另外配过、
3V/cm则是因为机器的关系只有50V和100V可以选择,
0.4ug/lane的量一直是够的
整个有差别的则是 8cm length gel,
由於器材的关系,我们实验室只能配的出小於8cm 的胶
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我想请问,
对於我使用了这种大范围的DNA marker的方法上还有甚麽遗漏的地方
除了8cm gel比较不太可能配的出来之外,
有办法使用现有的器材让他漂亮的跑开吗?
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※ 发信站: 批踢踢实业坊(ptt.cc)
◆ From: 111.252.105.63
1F:→ licat:先问甚麽是15kb之谱的质体? 04/04 23:43
2F:→ BGG:时间可以延长吧! 1hr 会不会太短了... 04/05 00:09
3F:→ BGG:如果延长时间还是不行的话,可能就要换方法了 04/05 00:10
是运气好刚好挑到成功的
pBR322(4K)+Neomycine gene(1.5k)+DsRed(0.7k)+Viral Nonstructure protein(9K)
有试过以0.4% gel 100V 跑上1h20min左右(放着跑去买午餐),
整个Band已经跑到胶的四分之三处,但是还是无法跑开他们
※ 编辑: fvf 来自: 111.252.105.63 (04/05 03:30)
4F:推 belady:50v 跑跳海 改用TBE buffer TAE 跑不出来 04/07 23:11