作者joycenino (joycenino)
看板Biotech
标题[求救] Roche Southern DIG
时间Sun Mar 10 22:38:09 2013
大家好:
想请教大家关於Southern DIG的实验问题...
因为本实验室尚无系统,我做了好几次都只有marker跟positive control有杂合讯号..
我的材料是比较少人做的中草药植物.."
用CTAB法抽取DNA
以下有几个问题想请教大家..> <
1.植物gDNA的浓度 (这应该是最主要的问题..?)
我之前都是用O.D值测DNA的浓度,同时也会跑胶check
虽然我知道O.D.值没那麽准...但还是用它估算约15 ug 的DNA
去切酵素
想问大家大概都拿多少的DNA去做southern dig
2.探针
想问大家做探针的方法,毕竟植物genome复杂,都会担心探针效率好不好
a. 说明书是写把insert接到T-vector里面,再用酵素切,跑胶回收片段
拿去做探针。但切胶回收感觉都会流失很多...这方法我还没试过
b. PCR产物直接以Kit纯化,之前都是用这方法做探针
探针效率以说明书的方法测试,也是ok的
c. PCR产物跑胶之後,切胶回收片段,这方法我也没试过..
这三种哪种方法比较好...?
3.目前实验室有两组Kit
DIG-High Prime DNA Labeling and Detection Starter Kit I
(Kit for color detection with NBT/BCIP)
DIG-High Prime DNA Labeling and Detection Starter Kit II
(Kit for chemiluminescent detection with CSPD, ready-to use)
我知道是呈色方法不同,据厂商说是CSPD比较灵敏..
但我用CSPD也没有成功过..
想问这两组kit哪一组比较好,或是有做成功的人可分享一下经验吗?
我已经失败到心灰意冷了> <
谢谢大家帮忙 及 耐心看完我的问题
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◆ From: 114.26.170.76
1F:→ blence:拿到probe最好的方法当然是1,vector切下来要多少有多少 03/10 23:01
2F:→ joycenino:那楼上都会照说明书写的"模板DNA浓度1ug"去做探针吗? 03/10 23:09