作者bbiioo (meimei)
看板Biotech
标题[求救] 如何从引子序列反推标的物序列
时间Fri Nov 16 23:05:34 2012
这个标题不晓得这样下适不适合...
问题是这样:
手上有两对引子 都是以前实验室学姐订购的
引子的资讯已经不复存在
只剩引子管身上写明基因名称(但其中一管字迹也模糊难辨)Tm值 及引子序列
现在要使用 我想要确定这引子是会合成出什麽基因的片段
还有长度是多少(此引子是for RT-PCR 所以应该是跨exon)
我自己是想过
看的出基因名称的 直接网路上搜寻此基因序列 利用网路软体找出引子 再跟
手上的引子比看看
不知道基因名称的 是否可以直接把序列作比对 看会对到什麽基因 这样
目前只想到这样
可是试过好像不ok....
想问问大家 有没有类似经验或是什麽建议的
谢谢了
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※ 发信站: 批踢踢实业坊(ptt.cc)
◆ From: 125.224.9.157
1F：推 qqmango:blast就可以了 11/16 23:11
2F：→ qqmango:进blast网站，把primer打进去，看夹出什麽基因就可以 11/16 23:11
3F：推 qiet:可以用NCBI的primer blast, 两条打进去 他会告诉你夹到什麽 11/16 23:22
4F：→ qiet:还有大小, 但要注意选的是cDNA or whole genome 11/16 23:23
5F：→ bbiioo:我再试试看罗 谢谢 11/19 22:08