作者cutebetty (Qb)
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标题Re: [求救]bisulfite Genomic PCR疑问
时间Sun Sep 16 02:01:55 2012
我这阵子有做三批bisulfite的PCR
第一次做try得要死才做出来
後来买了Hotstart的PCR mix
结果後来连anneling温度都不用测就可以P出专一的band
避免帮厂商打广告 如果有需要的可以站内信问我是用哪支Taq
希望可以帮到大家 ^^
※ 引述《travelmat (草蓆)》之铭言:
: 其实我也有同样问题...
: 我之前也是有TRY到一个比较好的条件
: 仅管做出来一样是smear一片,但相对明显有一条专一性的band(size是我要的)
: 本来预期是以为这样的condition是非常OK的
: 於是接下来的sample尝试以同样condition下去跑
: 却发现不同sample间无法重覆
: 而即使回到一开始的同样sample也无法repeat
: 问过别家有在做类似实验的,学长给我回应是
: 1.我sampleDNA是GENOMIC,genomic pcr本来就很麻烦又复杂
: 2.每次的BISULFITE处理後都视为不同的sample,也就是每次都可能会有不同的condition
: 3.primer suck
: 所以就......
: 而我问我们老师,我们老师给的答案是
: PCR就是一项amprify的技术,所以如果你这次primer能bind到正确的位置
: 那麽他理论上就是会放大,bind的相对多,专一性片段就相对亮
: 而bind的没相对多,於是就一片smear
: 简单来讲,以我的情况就是要看运气,这次运气好就有专一性这样。
: 我个人做法是把primer anealing的时间拉长,我的想法是
: 这样让primer有比较多的机率去bind到正确的片段(当然非专一性的也可能提高)
: 後来用这样做法的确是相对成功率比较高....
: 不过整体来讲还是成功率非常之低.......
: 目前是改成将PCR进TA,然後考虑用colony hybridization去抓哪个colony有我要的片段
: (我好想毕业阿.....)
: 以上希望对你有帮助....
: 如果你有进展也请分享给我和大家.....感谢你....
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◆ From: 1.162.82.166
1F:→ travelmat:学长说做bisulfite PCR taq真的超重要....所以他们家用 09/18 10:36
2F:→ travelmat:inv某牌白金TAQ......我们家用..........(默) 09/18 10:36