作者wjtseng (final)
看板Biotech
标题Re: [讨论] 病理切片IHC要怎麽看懂?
时间Sat Jul 28 02:47:31 2012
我有做过一些IHC的染色和分析
我的经验是这样
细胞核蓝色是Hematoxylin
细胞核棕色是染了p65使用DAB
计算比例的方式文章会有说
我的猜测是选定region of interest
数ROI内有多少个蓝色的细胞核 negative
数ROI内有多少个棕色的细胞核 positive
然後 positive rate=棕色#/(蓝色#+棕色#)
另外这边的统计是使用box plot
中间的那一条线是Q2 Second quantile 是 median 不是mean
box plot 最上面那一端是max
box上面那端是Q3 Third quantile 也就是 75th percentile
box下面那端视Q1 First quantile 也就是 25th percentile
box plat 最下面那一端是min
会使用box plot可以看出这组数据是否有左偏或是右偏, 数据分布,
有时也可以看出是否可能有outlier
至於显着的部份有可能是使用one-way ANOVA 也有可能是t-test
※ 引述《apiali89293 ( )》之铭言：
: ※ 引述《spirithorse (咩)》之铭言：
: : 因为最近Paper越来越多有病人检体的切片IHC
: : 但是没做过,所以也不知道该怎麽解读
: : 有些地方蓝色(我想应该是nuclear);但是红色有深有浅
: : 请问是否有达人可以稍微讲解呢?
: : 范例: http://ppt.cc/Msk8
: : 附带一提...能否顺便讲解右边的bar图要怎麽看??
: : 感谢!
: 我的硕论是病理相关，有一些IHC的DATA
: 图B的纵座标有写是染p65在细胞核内的表现 如何计算比例在文章内应有详述
: 蓝色的部分是细胞核没错，不过不是重点
: 重点是棕色的，因为细胞核染上p65会呈现棕色
: 这个实验主要是看p65在三种肿瘤组织中的表现(Tn、Tm、Lm)
: 很明显可以看到Tm和Lm中p65表现比较多，经统计分析後可能发现有显着差异
: 作者可能会解释说p65表现比较多可能和肿瘤的invasiveness有关
: 以上是我个人理解，欢迎指正
--
※ 发信站: 批踢踢实业坊(ptt.cc)
◆ From: 128.175.195.94
1F：→ a001ou:想请教一下 要如何避免挑选region的发生呢 每次染完IHC 07/28 16:31
2F：→ a001ou:总会发现大片组织会有些DAB较深 有些较浅 这真的很令人困扰 07/28 16:32
3F：→ wjtseng:其实应该是要看你染色的组织和想要看怎样的结果..我的样品 07/28 22:14
4F：→ wjtseng:染色後多半会选ROI..只有少数状况是全数..至於DAB深浅的 07/28 22:15
5F：→ wjtseng:问题..这个就要在染色的时候注意了..或是之前process影响 07/28 22:16