作者suhow (单身一辈子..)
看板Biotech
标题[求救] imageJ 计算细胞数
时间Mon Mar 26 16:10:44 2012
发问时请注意,若是要问实验相关的问题,请将实验的步骤、所用的条件大致列出
以方便板友帮您追踪问题
----请将上列注意事项以 ctrl + k 删除後开始编辑文章----
最近再做Hoechst染细胞核,看apoptosis
本实验室的方法是用相机ramdom拍九张相片
用肉眼判断apoptosis cells除以toatal cell
因为数量实在太大,想使用imageJ来计算total cell number
请问imageJ可以批次处理相片吗,还是一次只能处理ㄧ张相片
因为每次都还要重设条件实在太麻烦,
至於计算出来的结果我绝得没有很准确
像有些细胞aggregate再ㄧ起,他就判断不大出来
条件要怎嚜设定呢??谢谢大家。
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※ 发信站: 批踢踢实业坊(ptt.cc)
◆ From: 210.60.122.10
※ 编辑: suhow 来自: 210.60.122.10 (03/26 16:11)
1F:推 FireHell:这程式本来就很不准ˊˋ 03/27 03:21
2F:→ mzac1b:个人经验: 萤光强度一致的话 同一批相片就用同条件计算 03/27 05:49
3F:→ mzac1b:imagej 其中有 watershed 这个选项可以区分黏住的细胞 03/27 05:51
4F:→ mzac1b:其实一般文献都只有简述 "用imagej" 计算而已 03/27 05:52
5F:→ mzac1b:条件设定会很主观 但至少要有 正 负 control供参考 03/27 05:53