作者travelmat (草蓆)
看板Biotech
标题[求救] methylation 预测
时间Wed Mar 21 14:07:30 2012
我现在有一段序列，预期认为其上面有高度甲基化的情况
因此要探讨其甲基化对基因的影响
实验目前是以传统方式进行
即
1.bisulfite
2.分析甲基化程度
3. .......
目前卡在第一步
因此想换个方式，前後一起进行
也就是说
我期望能先预测哪些位置比较有可能被methylation
再由此下去测试
我的问题就是
有办法进行预测哪些位置会被甲基化吗? (CpG)
或是有网站可以丢进去分析?
找了一些paper没有很详细的说明
或是多是探讨别种基因的
有版友知是否有网站分析?
感谢
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※ 发信站: 批踢踢实业坊(ptt.cc)
◆ From: 140.120.130.105
这是设计MSP的网站
可以利用这方法预测是否会甲基化吗?
(小弟个人理解是应该不能的)
还是大大的意思是指叫我下去跑MSP看看该位置是否会甲基化?
※ 编辑: travelmat 来自: 59.126.67.149 (03/25 18:28)
2F：推 datro:她里面会告诉你 CpG位点 跟 CpG island的位置 至少目前还是 03/26 18:26
3F：→ datro:认为 promoter region的CpG 存在是必要的 03/26 18:26