作者pseudogap (就是爱你)
看板Biotech
标题[求救] RNA的OD值过高
时间Fri Mar 16 06:06:10 2012
最近在试用一个新的kit
主要是从全血同时将DNA和RNA粹取出来
步骤和抽DNA的时候类似
如果要DNA或RNA其中一种
就在利用DNase或RNase去除不要的东西
结果出来後 利用nano-drop测其浓度
DNA或RNA的260/280的值都奇高无比
DNA大约是4 RNA甚至有高到9
我大概查一下
似乎是因为酒精残留
但是我已经在hood风乾2个小时了
值还是这麽高
我们实验的目标是RNA
因此我主要希望是RNA够纯 才可以做接下来转cDNA的步骤
我看到网路上的资料有提到RNA的260/230的值也要留意一下
建议260/230的值要高过1.8 而我的260/230都不到0.1...
搜寻一下是因为有盐类等的干扰
但是不晓得要怎麽debug.... Orz
这次我试的sample是用paxagen kit fix过RNA的全血
但是他已经放了快5年了.... @@
我不晓得这样的sample是不是也会影响结果?
麻烦板上的高手帮我debug >_<
谢谢!!
以下是我的实验步骤:
AquaPreserve/Prosink皆为这个kit的reagent
1. Pre-warm the AquaPreserve solution to 22-37℃
2. Add 250 μl AquaPreserve to 250 μl whole blood in a 1.5 ml microfuge tube
3. Vortex until frozen blood-AquaPreserve thaw completely
4. Add 125 μl Prosink and vortex 1-2 min
5. Incubate 22℃ for more than 30 min
6. Centrifuge 14,000 xg for 10 min to pellet the proteins
7. Transfer 0.5 ml supernatant to a new 1.5 ml tube
8. Add 0.4 ml isopropanol to (7) and shake/vortex for 30-60 sec
9. Centrifuge at 14,000xg for 10 min to pellet the DNA/RNA
10.Decant to discard supernatant and gently add 50% isopropanol or 70%
ethanol to fill up the tube
11. Decant to discard the alcohol solution
12. Tap the tube on a paper towel to remove residual liquid
13. Leave it upside down to air dry the DNA/RNA pellet for 5-10 min
14. Add 100 μl deionized water to the DNA/RNA pellet and vortex to
solubilize the DNA and RNA
15. Add DNase and incubate 22~37℃ for 20 min
16. Incubate at 65℃ for 30 min to inactivate DNase
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◆ From: 149.142.103.92
※ 编辑: pseudogap 来自: 149.142.103.92 (03/16 06:07)
1F:推 Realthugz:5年你也用... 03/16 09:30
2F:推 Realthugz:nanodrop一直都只是参考 DNA而言跑胶才是真的 03/16 09:33
3F:→ f9361046:五年太夸张了喔....做得出来吗? 03/16 12:13
4F:推 qiet:...先抽管新鲜的血出来试试看吧... 03/17 01:39
5F:→ pseudogap:因为老板叫我先用5年的东西...Orz 那我先试新鲜的血好了 03/17 02:53
6F:→ pseudogap:谢谢<(__ __)> 03/17 02:53
7F:推 Ice9:你的第10步可以多做两、三次,把 salt 洗乾净些。 03/20 10:30