作者gqqueen (够幸福了)
看板Biotech
标题[求救] 跑PI时出现奇怪的图形(已解决)
时间Tue Feb 28 02:13:14 2012
今天跑PI时,如往常般的处理细胞(70%酒精 over night)及染色,
以往在DMSO control皆会有G1.S.G2/M明显的peak,但今天要在重复实验时,
却在FL2A-counts图只出现一个山丘状的图形也很不sharp,完全没有其他的Peak产生
而在FSC/SSC图细胞也不是均匀散布,反而有点椭圆形致密,然後在FL2-A/FL2-W
也没出现正常的图形,反而是一条长长的细胞带状图,调了很多次数值也一样,
叫出以前同样细胞同样处理的condition也是找不出问题
想请教版上的专家,有在跑PI时碰过类似的情况吗?
细胞的处理:药物处理 24 48 72小时
Control:DMSO
细胞打下来前都有先观察,和先前的实验差不多,这是reapeat实验
先谢谢大家的帮忙了
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◆ From: 122.117.13.40
※ 编辑: gqqueen 来自: 122.117.13.40 (02/28 02:20)
1F:推 FireHell:参数跑掉了 02/28 02:34
2F:→ gqqueen:可以请F大再详细说明吗 不懂参数跑掉指哪一个? 02/28 02:45
3F:推 FireHell:FSC, SSC, FL2, FL2-A, FL2-W这些参数的Voltage和amp 02/29 13:06
4F:→ FireHell:要调一下 02/29 13:06
5F:→ FireHell:另外椭圆形和带状都是正常的耶 02/29 13:08
6F:推 qiet:flow cytometry有受过什麽调整过吗? 02/29 19:31
7F:→ qiet:有的话参数要重抓 但如果机器都正常...可能要想别的原因 02/29 19:32
8F:→ gqqueen:隔天我有先拿别株细胞测试是不是reagent出问题,跑完之後 02/29 22:17
9F:→ gqqueen:都是对的,所以我马上拿我有问题的sample从新跑一遍, 02/29 22:17
10F:→ gqqueen:最後发现出现peak怪怪的只有在48.72小时,而24小时的都很 02/29 22:18
11F:→ gqqueen:正常,所以目前把问题缩小到48,72小时细胞前处理哪个环节 02/29 22:19
12F:→ gqqueen:但原因现在还不清楚,我唯一想的到的可能,是细胞收下来後 02/29 22:20
13F:→ gqqueen:放在室温一个小时,不知道是不是这样的因素 导致MDA-MB-23 02/29 22:21
14F:→ gqqueen:细胞出问题,才会跑出奇怪的图形,不知道大家觉得这样 02/29 22:22
15F:→ gqqueen:的解释合理吗?这是排除人为操作,reagent,flow熟练度 02/29 22:22
16F:→ gqqueen:唯一的可能解释了,因为这个实验我repeat两次都没问题 02/29 22:23
17F:→ gqqueen:就在最後一次出了问题了@@" 02/29 22:24
18F:推 qiet:细胞收下来後固定前我都会放在冰上or4度C 避免细胞产生奇怪的 03/01 01:14
19F:→ qiet:变化 03/01 01:15
20F:推 lyu0001:可能是同一批细胞固定染色不完全 03/01 10:25
21F:→ FireHell:不同时间点的FSC和SSC可以参数不同,GATING范围不同 03/01 14:15
22F:→ FireHell:看起来比较像是细胞型态在48H後剧烈变化而没有GATING好 03/01 14:16
23F:→ FireHell:另外一个可能就是你的TREAT会导致S phase arrest 03/01 14:17
24F:→ gqqueen:给Qiet 我48.72小时细胞收下来後,就摆在架子上,大约一小 03/01 20:08
25F:→ gqqueen:时以上= = 当时後再做另一个实验,所以就没先处理了,下次 03/01 20:08
26F:→ gqqueen:我会先放在冰上看看 03/01 20:09
27F:→ gqqueen:给F大我跑PI只有gateingFL2-A/FL2-W这边,然後我发现48小 03/01 20:10
28F:→ gqqueen:时候的细胞,在FSC/SSC这边有几管出现疑似两群不同大小的 03/01 20:12
29F:→ gqqueen:的细胞,但他们还是有重叠,形状类似於兔子的耳朵但有交叠 03/01 20:12
30F:→ gqqueen:不知道这样形容贴不贴切 03/01 20:13
31F:→ gqqueen:48小时以後的细胞 03/01 20:13
32F:→ gqqueen:给L大我细胞都固定至少24小时,然後染色也有两个小时以上 03/01 20:14
33F:→ gqqueen:避光保存,这样还会发生染色固定不完全吗? 03/01 20:15
34F:推 FireHell:收细胞要快,所以放1h绝对不ok,不过会不会导致这些结果 03/02 15:12
35F:→ FireHell:不得而知,建议下次收细胞要连续之外,可参照这篇 03/02 15:12
37F:→ FireHell:另外注意流速控制在LOW SPEED 100 EVENTS/SEC 03/02 15:15
38F:→ gqqueen:谢谢F大提供这个很棒的资料,可以把参数条得更好,非常谢 03/02 22:18
39F:→ gqqueen:谢你,这次重做我不敢再放那麽久了,本来以为不会出什麽 03/02 22:18
40F:→ gqqueen:什麽问题,看来下次收下来前一定要先放冰上,尽快固定 03/02 22:19
※ 编辑: gqqueen 来自: 122.117.13.40 (03/02 22:19)
※ 编辑: gqqueen 来自: 122.117.13.40 (03/02 22:20)