作者rockerwei (才女)
看板Biotech
标题Re: [求救] 用旧的agarose gel跑RNA
时间Sat Nov 12 15:36:05 2011
※ 引述《rockerwei (才女)》之铭言:
: ※ 引述《pocession (阿宗)》之铭言:
: : 嗯 可能我的意思让你有点误解
: : 要跑RNA Marker的原因有两个
: : 一个是DNA的分子量没有办法代表RNA (DNA为双股,RNA为单股,单体的分子量也不一样)
: : 另一个是确保你在SAMPLE prepare或是跑胶的过程中RNA没有分解
: : (如果跑胶的流程中出错,RNA marker就会分解了,以此作为判断)
: : 所以你用DNA marker作比较,是没办法作任何判断的
: : 另外,根据我的经验,胶的新鲜与否并不是很直接的影响
: : 主要是跟你放置的容器和跑胶的buffer有很大的关系
: : 容器要乾净,跑胶的buffer尽量灭过菌,然後要跑时再稀释(要用二次水),
: : 如果要把RNA sample作变性处理
: : 可以自己配制含formaldehyde的loading buffer就好了,满便宜的
: : 如果不想买RNA marker,可以自己用acid phenol抽新鲜的大肠杆菌(养至对数期的细菌)
: : 里面会有5S, 16S, 23S;可以帮助你判断位置和跑胶流程有没有发生问题
: 再求救一次~我这次已经用新的buffer跑了~可是还是没有18S和28S的band
: 我在想是不是配胶的问题
: 因为我是直接拿DNA的agarose gel来跑
: 请问大大们
: 有没有配RNA gel 的配方~~
整个流程就是抽完RNA然後我拿5ul去跑胶
大概是100v
抽RNA的流程就是用组织研磨器加上Tri-zol(3ml)放在50ml的tube里面打碎
再加入1ml的chloroform~然後votex再分装到eppendorf里面~
等五分钟~在离心12000rpm 10 min
离心後取上清液
加入isopropanol等30min
离心12000rpm 30min
用DEPC-EtOH wash 离心12000rpm 10min
吸乾酒精~加DEPC-H2O
然後就测浓度~跑胶~~~
我真的不知道发生什麽问题
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◆ From: 220.137.0.109
1F:→ GauYi:你抽的样品是? 11/12 16:14
2F:推 f9361046:胶图是smear还是什麽都没有?那260/280呢? 11/12 17:19
3F:→ a0946113:浓度多少啊? 260/280 有1.8以上吗? 11/12 18:15