※ 引述《rockerwei (才女)》之铭言： : ※ 引述《pocession (阿宗)》之铭言： : : 根据经验 : : 如果你的agarose gel做好後，是以密封的方式保存 (E.G 放在保鲜盒) : : 而且保存用的buffer是乾净的 (E.G DEPC water)， : : 跑的时候buffer也是新鲜配制的 : : 那放一个礼拜以上的胶并不会让sample产生degrade : : 还有 就算是degrade的RNA也是测得到OD的，OD不代表完整性 : : 不过就像推文说的 还是要跑marker才能判断你的情况 : 不过我们实验室也只有用DNA maker来看18s和28s是不是对的 : DNA maker跑得很正常 : (RNA有特别的maker吗?) : 我们的胶只是单纯放在一般的保鲜盒 : buffer已经跑到都要不行了 : 所以还是要用全新的胶全新的buffer来跑会比较好就对了 : (因为实验室check PCR pruduct也都是用旧得胶旧的buffer跑~但band都很正常) : 因为在以前的实验室都是要跑才做胶所以RNA也都是正常的 : (而且还有先denature处理过才跑，做的胶有外加ATA) : 所以不确定是因为跑旧胶的问题还是没有经过denature的处理 : (现在的实验室有点穷，所以都没有处理RNA就直接跑了~) 嗯 可能我的意思让你有点误解 要跑RNA Marker的原因有两个 一个是DNA的分子量没有办法代表RNA (DNA为双股，RNA为单股，单体的分子量也不一样) 另一个是确保你在SAMPLE prepare或是跑胶的过程中RNA没有分解 (如果跑胶的流程中出错，RNA marker就会分解了，以此作为判断) 所以你用DNA marker作比较，是没办法作任何判断的 另外，根据我的经验，胶的新鲜与否并不是很直接的影响 主要是跟你放置的容器和跑胶的buffer有很大的关系 容器要乾净，跑胶的buffer尽量灭过菌，然後要跑时再稀释(要用二次水)， 如果要把RNA sample作变性处理 可以自己配制含formaldehyde的loading buffer就好了，满便宜的 如果不想买RNA marker，可以自己用acid phenol抽新鲜的大肠杆菌(养至对数期的细菌) 里面会有5S, 16S, 23S；可以帮助你判断位置和跑胶流程有没有发生问题 --

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