作者rockerwei (才女)
看板Biotech
标题Re: [求救] 用旧的agarose gel跑RNA
时间Sat Oct 22 20:00:38 2011
※ 引述《pocession (阿宗)》之铭言：
: ※ 引述《rockerwei (才女)》之铭言：
: : 今天用做了一个礼拜的agarose gel跑RNA
: : 结果照胶的时候发现RNA都变成degrade的状态了
: : 不过测O.D.又是正常的
: : 请问是不是要run RNA gel最好还是用新的胶run
: : P.S.我是早上抽RNA下午跑应该没有冰冻解冻的问题
: 根据经验
: 如果你的agarose gel做好後，是以密封的方式保存 (E.G 放在保鲜盒)
: 而且保存用的buffer是乾净的 (E.G DEPC water)，
: 跑的时候buffer也是新鲜配制的
: 那放一个礼拜以上的胶并不会让sample产生degrade
: 还有 就算是degrade的RNA也是测得到OD的，OD不代表完整性
: 不过就像推文说的 还是要跑marker才能判断你的情况
不过我们实验室也只有用DNA maker来看18s和28s是不是对的
DNA maker跑得很正常
(RNA有特别的maker吗?)
我们的胶只是单纯放在一般的保鲜盒
buffer已经跑到都要不行了
所以还是要用全新的胶全新的buffer来跑会比较好就对了
(因为实验室check PCR pruduct也都是用旧得胶旧的buffer跑~但band都很正常)
因为在以前的实验室都是要跑才做胶所以RNA也都是正常的
(而且还有先denature处理过才跑，做的胶有外加ATA)
所以不确定是因为跑旧胶的问题还是没有经过denature的处理
(现在的实验室有点穷，所以都没有处理RNA就直接跑了~)
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◆ From: 220.137.13.206
1F：→ huuban:有RNA marker喔，单股双股都有，颇贵的... 10/22 20:44
2F：→ Realthugz:胶我都做好泡在buffer放上个把月的... 10/22 22:27
3F：→ Realthugz:如果是看18s 28s我是跑过的 非现做的胶没问题... 10/22 22:28
4F：→ Realthugz:我是菌液加phenol上清拿去跑 都看得到那两条喔 10/22 22:30
5F：→ Realthugz:以上主要是跑看有无plasmid 会顺便看到18s 28s 10/22 22:32
6F：→ Realthugz:欧 菌应该是 16s 23s 10/22 22:34
7F：→ popopig2000:denature就利用formaldehyde和加温65度就好了 10/23 00:27