作者qtzbbztq (阿杰)
看板Biotech
标题[问题] CpG island 的定义
时间Thu Aug 4 16:14:42 2011
CpG island的定义可能有不同的版本
我查到的一个版本如下
A 500 base pair window with a G+C content of at least 55% and
an observed/expected CpG frequency of at least 0.65.
想请教的是
55%那个很好懂
但是observed/expected CpG frequency 至少要0.65这部分
所谓的expected CpG是怎麽决定的?
不知道是否有人对这个领域熟悉的可以协助
谢谢
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※ 发信站: 批踢踢实业坊(ptt.cc)
◆ From: 140.112.1.187
1F：→ blence:将ATCG排成n个bp所产生的随机序列中,恰巧含有CG顺序的比例 08/04 16:51
2F：→ blence:如果n=2,机率只有1/16,随着n增加,应该会趋近1/4 08/04 16:57
3F：→ qtzbbztq:感谢您! 08/04 17:46