作者FUJI0904 (FUJI0904)
看板Biotech
标题[方法] 关於Caspase3和PARP的Western以及细胞周期相关问题
时间Mon Apr 11 12:09:17 2011
各位先进,小的有个问题想请教
最近刚做完药物MTT的实验,接着要转到看Cell cycle的部分
老板的意思是,如果SubG1有明显增加的现象,就要看药物是否引起
Mitochondrial apoptosis,所以接着要看 Caspase3 或 PARP 的活化与否
在MTT中可以很明显的在 24 h treat 後看到 cell viability 下降
而在cell cycle上礼拜跑的结果却发现相较 control组,SubG1 并没有明显增加
反而有 arrest 在 S phase 的情形,有同学在做 cell cycle 的跟我说,让我延长作用
时间
因为如果可以发生 arrest,之後有可能就走进 apoptosis,这件事是对的吗?
之所以不染 Annexin V 只是因为老板觉得太贵,之前学长用完就不想再买了>"<
另外,由於之後可能要做 caspase3 和 PARP 的 WB
所以我问了学长姐,结果得到这两个 protein 都不好染
尤其是在 whole cell lysate 的状况下,由於表现量本就不高,不是很好做
让我有点心慌,我就稍微去查了一下,发现压得很好的 data 没有提细节
有提细节做法的其实 data 也不清楚
我有看到有人的论文提及他们在做 WB 时会每个 well loading 30~50 ug 的
whole cell lysate,跟一般一个 well 不会超过 20 ug有点不同,不知是否为了解决表现
量比较少的问题?
有没有人有相关经验可以指点迷津的?
我学长是有说 PARP 可以直接抽核蛋白,增加每单位体积中 PARP 浓度...
但caspase3就不知该怎麽办了...
恳请指引我一盏明灯吧!!!!
--
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◆ From: 140.117.39.44
1F:→ celestial318:caspase-3我记得不难压欸...虽然很久以前的事= = 04/11 13:45
2F:推 im9527tw:caspase 3跟PARP都不难压,我也都是whole cell lysate 04/11 13:54
3F:→ im9527tw:well loading 20~40ug,表现量都很多 04/11 13:55
4F:推 kakaman:两者皆可用whole cell lysate 04/11 19:00
5F:→ FUJI0904:谢谢楼上诸位的见解^^,我想再问一下,我知道 04/11 19:22
6F:→ FUJI0904:pro-caspase3还算好看,但因老师不喜欢以pro的减少当作 04/11 19:22
7F:→ FUJI0904:活化,还是希望看到cleavaged form,请教这两种蛋白的 04/11 19:23
8F:→ FUJI0904:cleavaged form也会跟pro一样明显吗? 04/11 19:24
9F:推 kakaman:cell signaling的cleaved caspase-3很好压 04/11 20:20
10F:推 celestial318:嗯...以前用IMGENEX的casp-3 pro跟cleaved都有 04/11 21:56
11F:→ FUJI0904:感谢大家^^,我们实验室的好像是cell signaling的 04/12 03:02
12F:→ FUJI0904:不知道能不能请教一下kaka大的条件呢? 04/12 03:03
13F:→ FUJI0904:因昨天同学去压,用我们实验室的条件,cleavaged form 04/12 03:03
14F:→ FUJI0904:非常不明显...学长非常认同这样的结果...囧rz 04/12 03:04
15F:→ FUJI0904:我们是loading 20 ug 的 whole cell lysate 04/12 03:05
16F:→ FUJI0904:感谢kaka大 04/12 03:05
17F:推 im9527tw:我们家是用ZYMED的抗体,压出来的Cl-casp 3也很明显 04/12 11:33
18F:推 celestial318:loading多一点或抗体浓一点试试看XD 04/12 13:10
19F:→ tincta:我之前也是用cell signaling,同样pro-明显.cleaved不明显 04/12 20:46
20F:→ tincta:据前辈说法,可以试试看从膜中间横切,分开1抗,会有帮助 04/12 20:51
21F:→ FUJI0904:t大的意思是把pro和cleavaged剪开 04/12 21:57
22F:→ FUJI0904:然後压同样的抗体吗? 也谢谢kaka大的回信^^ 04/12 21:58
23F:→ FUJI0904:我都会试试 04/12 21:58
24F:→ kentingabc:目前也在跑,跑了好多次背景都很高(很脏),不抱希望的 05/03 23:26
25F:→ kentingabc:把膜放着,洗了三天,今天压出背景超乾净的Caspase3 05/03 23:27