作者waitingu (Phil-Ku)
看板Biotech
标题[求救] 关於protein-protein interaction的模拟
时间Mon Mar 28 17:11:12 2011
由於之前用coIP有发现A protein与VEGFR有interaction
(已经double check用两边去抓另一种)
老师想要讨论:A是跟VEGFR的哪个domain interaction,怎麽去interaction
当然这要搭配construct不同domain的VEGFR,再用IP确认的data才能确定
但由於所上没有人有做modeling相关的研究,而老师又很坚持,一定要先有模拟的model
(个人认为这两个data是相辅相成的)
由於A与VEGFR在PDB都已经有结构解出来了,想请问版上有做这方面相关的板友
有可能用软体或是程式可以满足老师的需求:模拟两个已知结构蛋白质的interaction吗?
如果可以我再去寻找合作的实验室,感谢大家的回答^^
--
※ 发信站: 批踢踢实业坊(ptt.cc)
◆ From: 140.112.25.54
1F:推 McRay:Discovery studio 03/28 23:37
2F:→ McRay:先做实验帮助Docking更准确 或是先Dock帮助实验更顺利 03/28 23:39
3F:→ McRay:看要从哪边开始了 03/28 23:40