作者xenosaga1026 (sam)
看板Biotech
标题[求救] 利用IP-->Mass 的方式探讨protein-protein interaction
时间Wed Mar 23 23:40:04 2011
各位大大好
不知道有没有人做过
将culture cell内的某protein IP下来
然後上Mass (shotgun proteomics)
来看哪些protein与某protein有interaction呢?
小弟目前求助无门
有以下疑惑
1.将protein IP下来後不知道要选哪种elution buffer较适合後面上质谱仪?
目前已知有
1.Glycin (pH 2)
2.1%SDS
3.Urea
2.Cell的量要多吗?
3.建议上哪种质谱仪呢? LC-tandem-MS or MALDI-TOF?
希望有经验的大大可以分享经验QQ
谢谢
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※ 发信站: 批踢踢实业坊(ptt.cc)
◆ From: 114.24.71.164
1F：推 jethuang:如果是做LC/MS,protein抓下来之後直接送去打应该可以!! 03/29 15:37
2F：→ jethuang:但MALDI-TOF不太清楚,你可以问帮你做分析的人! 03/29 15:38
3F：→ jethuang:我自己是做CO-IP之後跑2D所以没有这样的困恼><" 03/29 15:39
4F：推 inchew:你的东西不够纯的话:LC/MS(Maldi-TOF需要够纯)，细节问题 04/06 18:57
5F：→ inchew:建议直接写信请教相关实验室，或是直接问未来送LC/MS的单位 04/06 18:59
6F：→ inchew:可以收获很多，他们有时也会给你建议或策略 04/06 18:59
7F：推 greendeer:你要先决定要做in gel 还是 in solution digestion 04/05 22:18
8F：→ greendeer:如果是in gel就要先跑胶，再挖band。in solution的话， 04/05 22:19
9F：→ greendeer:我建议你问相关实验室 04/05 22:19