作者aggaci (台南工作的基隆人)
看板Biotech
标题Re: [求救] Ligation的cutting site接近
时间Wed Nov 3 13:54:50 2010
※ 引述《keepseaching (绝心忘情)》之铭言:
: 我在进行的实验是将一段A基因约1kb
: 接入pCambia2301这个vector约13kb
: 所用的cutting site为BamHⅠ与XbaⅠ
: 所用的条件如下
: Insert 10μl
: Vector 4μl
: bufferA 2μl
: bufferB 2μl
: Ligase 2μl 4℃反应overnight
: 做了数次却接不起来
: 基本上我的A基因与vector都check过了
: 所以我在猜想
: 是否是因为我选用的这两个cutting site相邻
: 导致用酵素切的时候没办法两端都切
: 不知版上有经验的版友
: 有没有遇过类似的问题
可以参考这网站(不好意思 懒的缩网址)
http://www.neb.com/nebecomm/tech_reference/restriction_enzymes/
cleavage_olignucleotides.asp
理论上xbaI酵素尾端只多1个nucleotide效率很差!根据这个表的结果效率~0
建议你先切XbaI再切EcoRI,EcoRI没这个问题
另外XbaI很容易受到甲基化的影响
http://www.neb.uk.com/productcatalogue/productinfotransfer.aspx?id=faq-R0145
若是他附近的site被甲基化就没办法切
(这个vector上面应该会标是他是否有被甲基化,若有就要用不会甲基化的菌来作)
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※ 编辑: aggaci 来自: 140.116.253.121 (11/03 14:01)
1F:→ blence:看错表了,应该看one end,不是two end,而且原po是看BamHI 11/03 16:05