作者Fourfish (~四条鱼~)
看板Biotech
标题Re: [求救] 基因序列注册
时间Tue Sep 7 16:17:10 2010
我两年前注册过序列...
现在记忆也快没了..XD
但我试着解释一下你遇到的问题 希望对你有帮助
因为NCBI是种综合的资料库 可以查询Protein, Nucleotide, EST等等序列资料
因此当注册序列时 需要说明你要上传的是何种序列 以利资料库的合并与整理
从你的叙述来看 你应该是没告知GenBank你的序列是属於哪一种序列
所以系统要求确认并选择你的序列种类:
1.你的序列如果是可转录转译的,包括蛋白质序列、DNA基因序列等
应该在第一项 Coding Region(s) 加入你的序列数量
2.你的序列如果属於RNA的序列,那应该在第二项 RNA Features(s) 输入
(我想它说明也很清楚 包括哪类的RNA序列了)
3.如果是其他类的序列 例如:promoter、repeat element、UTR、intron和exon等
如果我没记错的话...
每一项加入时 应该会再询问你序列类型跟范围吧
举个例子来说:
如果你的序列是一条你们实验室新定序出来的"完整的DNA基因序列"
图例
promoter UTR exon1 intron exon2 UTR
DNA
+==========+=====+=======+=========+=======+=======+
那应该要输入
1 coding region (gene)
6 other features (promoter, UTR x2, exon x2, intron)
ㄟ都...更详细一点的话 应该要再输入mRNA跟protein的序列
另外 若有些分类你不太清楚 也可以参考NCBI中其他的序列 FEATURES的部份
以上
如有错误或缺失的地方 还烦请近来用过的人指正搂!XD
※ 引述《BarryJones (伊果邦)》之铭言:
: 大家好
: 小弟目前手上有一条基因序列必须注册
: 使用的是NCBI的blankit
: 但是由於没有注册经验
: 因此遇到了以下问题
: 当我其它表格皆填写完毕後
: 网页出现的字如下:
: **** You're not finished yet! ****
: --------------------------------------------------------------------------------
: Review your entry below, then choose either Modify Submission or Submit to
: GenBank.
: To add coding regions and other features, or to make corrections, enter the
: number of features you wish to add. Then press the Modify Submission button
: to return to the submission form.
: Add ( 0 ) Coding Region(s) (Includes information about proteins, genes, mRNA
: intervals)
: The protein sequence and related information are among the most important
: and useful components of a sequence entry - if these are available, please
: include them!
: Add ( 0 ) RNA Features(s) (premessage RNA, mRNA, tRNA, rRNA, ncRNA, tmRNA,
: other/miscRNA)
: Add ( 0 ) Other Feature(s) (includes exons, introns, repeat elements, UTRs, etc.)
: <Modify Submission> <按键处>
: Your Entry is NOT complete until you press Submit to GenBank.
: <Submit to genebank> Submit final draft. LAST STEP! (Please do this only once for each sequence
: submitted.)
: ----------------------------
: ()中的"0"是可以填入数字作修改
: 不知道有没有人也遇过雷同的事呢???
: 可否传授经验以解决小弟的问题!!!
: 非常感谢!!!
--
※ 发信站: 批踢踢实业坊(ptt.cc)
◆ From: 140.116.94.157
1F:→ Fourfish:PS.如果没有promoter这项 那应该并入UTR这部份 数量要-1 09/07 16:20
2F:推 BarryJones:四条鱼~感谢您~我会针对你的建议再注册一次~谢谢!!! 09/08 20:45