作者sancra (Lab Pub Orz...)
看板Biotech
标题[求救] gene expression database
时间Tue Jul 20 23:18:37 2010
我想请问有没有database
是可以查gene在各个cell line里的expression情形
我通常都会上UCSC去找资料
不过那里只能找到在normal tissue的expression array
所以想问一下有没有别的database
是有整理各个gene在各个现存的cell line里的expression profile
烦请指教，谢谢
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※ 发信站: 批踢踢实业坊(ptt.cc)
◆ From: 122.121.205.216
1F：推 spirithorse:其实我看不太懂,但是NCBI有个OMIM(在右边的选项) 07/21 00:20
2F：→ spirithorse:填入gene後可以看到大概的研究方向还有reference 07/21 00:21
3F：→ sancra:喔，我的意思是有个target gene想要knock down 07/21 08:35
4F：→ sancra:但我不太确定要在哪一株cell line做knock down 07/21 08:35
5F：→ sancra:其实应该做个western看看哪株cell line有表现我要knock 07/21 08:36
6F：→ sancra:down的gene，但我们lab太多cell line了....所以我想说不知 07/21 08:36
7F：→ sancra:能不能先找个database看看，就不用这麽麻烦了 07/21 08:37
9F：推 hwjuranus:楼上的网站也大部分是normal tissue 07/21 09:33
10F：→ hwjuranus:cancer cell-line的话 很少看到有提供expression的 07/21 09:34
11F：→ hwjuranus:我们自己是有分析的cell-line expression 07/21 09:35
12F：推 aceliang:用nci的database？ 07/21 16:59
13F：→ rimeni:biogps有cancer cell line的expression profile 07/22 12:10