作者datro (无解)
看板Biotech
标题Re: [求救] real time PCR primer设计
时间Sun May 30 03:07:02 2010
※ 引述《midnight4 (midnight)》之铭言：
: 借标题问一下
: 一般大家都是设计跨intron的primer
避免Genomic DNA contamination
: 但是好像很少会考虑primer dimer造成的影响
: 是为什麽呢？
Syber Green 要考虑 primer dimer
Hydrolysis probe (Roche UPL)不用
很贵的Taqman不用设计也不用
原因起参考其原理不同
: 常常为了跨intron因此怎麽调都有hairpin or primer dimer...
: 另外有些基因他的intron很少或是刚好都在5'端
: 这样大家还会去设计跨intron的primer吗？
能设计就设计
不能设计 就操作时避免genomic DNA contamination可能性
顺便附上两个网站 是设计primer的
Roche UPL (Roche hydrolysis probe用) 可能会有primer dimer
http://ppt.cc/PsRo
Primer bank (For SyberGreen system)
http://pga.mgh.harvard.edu/primerbank/
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本人是个死孩子 还没用过syber green system （欠打）
但是 有老师说上面这个primer 大约有90％可以for SyberGreen
就参考看看罗！
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