作者lovenainai (lovenainai)
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标题Re: [求救] 萃取动物组织DNA出现胶状物
时间Sat May 8 05:27:12 2010
※ 引述《kennezoe ()》之铭言:
: 我们实验室会剪老鼠尾巴来萃取DNA
: 方法是
: 1.尾巴剪碎,加入TNE buffer 300ul及proteinase K煮overnight
: 2.加Phenol/Chloroform/Isoamyl Alcohol, 25:24:1 300ul mix後离心取上层,这步骤
: 做两次
: 3.加Chloroform/Isoamyl Alcohol 24:1 300ul mix 後离心取上层,这步骤做两次
: 4.加isopropanol(-20℃) 300ul invert
: 5.加70%ethanol(-20℃)invert
: 6.加100%ethanol(-20℃)invert
: 7.DNA pellet 乾燥後以TE buffer回溶
: 通常在加入isopropanol之後,就会有白色丝状物出现,在离心後,会是白色的小pellet
: 贴附在eppendorf底部。
: 然而有时加入isopropanol,也会有白色丝状物,但过一段时间或离心後,却沉淀出透明
: 的胶状物或是胶状物包裹白色pellet,这种胶状物比较大团又滑溜,有时可以回溶有时又
: 不行,取出来测的260/280 ratio也正常,可是用来PCR却常失败。
: 想请问大家,这种胶状物到底是什麽东西,如果不是DNA,又要如何避免萃取到它?
应该是 collagen
经过 proteinase K digest 55度 o/n 之後
先离心十分钟 然後用 p1000 去取上清 然後如果有吸到这团东西
我都直接把她像鼻涕一样拖出来丢掉
剩下的上清液 直接用 isopropanol 沉淀出来酒精 wash
air dry 回溶之後就可以拿来 PCR
有用 chloroform 处理会比较乾净
我只有做 southern 的 genomic DNA 会这样处理
另外我取 proteinase K 的时候都会把 tip 头剪掉
不然吸起来的量跟应该有的量会差蛮多的 (我用 1:100)
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