作者eyest (李察狄恩安德森)
看板Biotech
标题[闲聊] CNM compartmental protein extraction kit
时间Fri Apr 16 17:03:19 2010
不知道在版上可不可以分享kit的实验流程
若不行请告知一声,我会删除的
会想要分享这篇主要是因为看步骤两个小时左右
就可以搞定的东西,却花掉我半天的时间,真的很
抓狂,尤其是其中一个步骤很搞刚,用掉超多时间的...
以上闲话讲完了,进入这套kit的说明吧~
这套kit是用於分离细胞或是组织的细胞质,核及膜的
技术,比起传统的方式,一般平均需要两天的工程吧,
相对於这套kit方便多了,时间也省下不少呢。
这边我是使用皮肤角质层细胞HacaT 细胞,也许是因为
这种细胞的特性特别坚强,害我要打破细胞花掉1.5小时
真的很无奈...
这组kit有限制细胞,最高可以使用2*10的7次方细胞数,
最低可以使用2.5*106细胞,因为在步骤里已经标示好
最高细胞数所需要的buffer量,所以我第一次先使用
4*106细胞数,方便换算说明书里面需要用的量。
我是种在6 well里面medium去除,PBS洗两次,加
trypsin-EDTA,切下细胞,收集到小tube里,室温,2000rpm,5min
去除trypsin-EDTA,加入kit的buffer C 400ul (额外加入ki附的
protein inhibitors cocktail 3.18ul),4C,摇20分钟
2. 接着使用针头孔径26.5~30的针打破细胞,在这边我是用
孔径30,1CC包装的针打破细胞,让细胞质出来,在这边说明书上
提到说大约来回冲打细胞50~90次左右,就可以使细胞破裂至95%
原本还在想说要这麽多次,手部就酸死了,一开始还很有耐心的数
冲打几次,半小时过去了,我也懒的数了,取几滴放到6 well的盖子上
拿到显微镜下面观察,这些细胞也太健壮了吧,每颗细胞都完好如初
是我对你们太温柔了吧...接下来我就决定将细胞抽起来在大力的
冲到tube里,两三次後,tube里面的泡泡变多,再放慢速度冲打
这样来回半小时後,心想这样没问题了吧,在取一些到显微镜下面观察
确实跟上一次看到的细胞数比较有比较少了,但还是有很多细胞
很强壮,就是不破,是因为皮肤细胞特别坚强吗?只好再继续冲打的
动作...持续了1.5小时,再次观察,终於阿,我可以离开冲打细胞的
窘境里了,在显微镜下看,细胞数量已经寥寥无几了,照理说
应该要在多打几下的,但是我已经在这个步骤花掉太多时间了,决定
往下个步骤走,4C,13000rpm,20min,保留上清液(这就是我要的细胞质阿)
3. 清洗一下pellet,取kit的 buffer W 800ul(加protein inhibitor
6.36ul) 在4C,摇5min,接着4C,13000rpm,20min,丢掉上清液
4. 加入 buffer N 200ul (加protein inhibitor 1.59ul),在4C,摇5min
接着4C,13000rpm,20min保留上清液(收集到第二个细胞核啦~)
5. 直接加入buffer M 200ul (加protein inhibitor 1.59ul)在
4C摇5min,接着4C,13000rpm,20min保留上清液(连细胞膜的部分也到手了)
6. 接着就是测浓度~原本想说每一管的量至少都有200ul可以用很多次
没问题吧,测出来却发现细胞质浓度高>细胞核>细胞膜...
假设细胞质的浓度是1ug/ul,细胞核就是0.5ug/ul
细胞膜更惨,只有0.3ug/ul左右,也太低了吧,这样我跑western
是要load多少阿...跟老板说明这情形之後,老板说其实测细胞质核膜
浓度不用到非常高,不然就是细胞质和核都用15ug,细胞膜用10ug
跑一次western,压不同抗体看看有没有分离乾净,下次再做实验
的时候可以把buffer的量都减少,这样浓度就会提高了。
我也是这样想的,所以以上的步骤流程是我第一次做的量,第二次
再抽细胞质核膜我就会把抽细胞核和膜的体积都减少,
细胞质(buffer C)加 400ul
细胞核(buffer N)加 100ul
细胞膜(buffer M)加 50ul
这样浓度应该就可以提升了吧~哈哈,等我在做一次再看看吧,
但是我不是很想再碰这个实验了耶...再抽打细胞那个步骤花掉我
超多时间的,连中餐都是请同事帮我买回来的,真的很麻烦...
以上的闲聊加分享到此告一段落啦,若是不能po这种文章请告知
我会尽快删除,谢谢大家耐心的看完我的文章阿...
写文章都没有做实验累了,虽然说比这个实验更复杂的实验一大堆
但是就是想上来抒发一下~~
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