作者Fourfish (~四条鱼~)
看板Biotech
标题Re: [求救] 请教non-reducing western blotting 的 …
时间Sat Apr 10 12:55:02 2010
关於polyacrylamide electrophoresis的部分
Denaturing electrophoresis: (请把字看清楚喔!!)
Reducing condition - Sample dye 含2-Me或DTT
Buffer 含SDS
Sample 要煮
Non-reducing condition - Sample dye "不含"2-Me或DTT
Buffer 含SDS
Sample "不能"煮
以上两者都可称为SDS-PAGE 因为都含SDS
差别只在於reducing reagent的有无
SDS可让proteins带负电 但也会破坏non-covalent bond
影响complex及可能影响protein folding
所以non-reducing的proteins也并非在native的状态 (所以称denature)
但部分可以保留住protein的structural epitope供Ab辨识
Non-denaturing electrophoresis:
Native condition 也就是所谓的native PAGE
所有dye、buffer都不含2-Me或DTT及SDS
[所以sample dye只含有buffer(控制pH)、glycerol(沈降)跟tracing dye]
Sample不能煮
Buffer system也不太一样(制胶跟running buffer)
我用过TBE 也看过Tris/Glycine的protocol 不过差异在哪我还不太清楚...
在Native PAGE中 让proteins电泳只靠proteins自己的电性
可以透过protein PI跟调整buffer pH使之带负电以进行电泳
但也因为变因太多(PI、pH、size、shape、complex、interaction等)
所以跟marker比对大多会不准...而且bands可能会很丑...XD
PS.如果是棘手的membrane protein想在native下跑电泳
可参考"Blue native PAGE (BN-PAGE)"
以上是我对PAGE的了解
至於Western blotting的部分
只要proteins带负电、可以跑电泳
那一定可以用电转法将proteins transfer到membrane上 (因为原理跟电泳一样啊~XD)
SDS-PAGE无论是reducing或non-reducing一定没问题
而native-PAGE则要控制电压、时间、调整buffer等
你如果想做native-PAGE的Western blotting
请google一下
http://tinyurl.com/y39thp3
看完後你会发现...
基本上Western blotting的作法是一样的...XD
PS.我不解的是...你文中的意思应该做了两次都有出来
但你老板为什麽只在意有没有SDS...= =a
※ 引述《sjacky (陈小文)》之铭言:
: 大家好:
: 最近买了一只抗体 Chemicon, Anti-Apolipoprotein H
: 在Datasheet http://0rz.tw/n6ZTL 上面有写到non-reducing这个部份
: 问sells的结果他说,在sample buffer的部份不要加入B-me,其他部份都一样
: 依照他的说法,做了两次,结果拿给老板看
: 老板说 non-reducing的话,连SDS都不能加
: 想要请教一下,有没有人有作过的
: 想要请教一下作法跟一般western blotting有什麽差别
: 谢谢
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※ 发信站: 批踢踢实业坊(ptt.cc)
◆ From: 140.116.94.205
※ 编辑: Fourfish 来自: 140.116.94.205 (04/10 13:00)
1F:推 SugarSa:在SDS那边,reducing不一定要煮,non-reducing也不一定不 04/10 14:11
2F:→ SugarSa:能煮 04/10 14:11
3F:→ sjacky:谢谢你的回覆,老板之所以会说SDS的关系,可能是因为跑出来 04/10 17:25
4F:→ sjacky:的结果,Band一整个拖曳,老板可能觉得是蛋白都分离了 04/10 17:27
5F:→ sjacky:因为SDS的关系,没有聚集在一起,还是谢谢,我星期一再作 04/10 17:28
6F:→ sjacky:看看。^_^ 04/10 17:28
7F:→ Fourfish:一楼说的也对 只是大多reducing会煮是能帮助2-Me DTT作用 04/10 17:32