作者HAYATO (黑眼圈...)
看板Biotech
标题Re: [讨论] 大肠杆菌中含多少DNA pol I
时间Fri Apr 2 06:37:55 2010
※ 引述《ararthur ()》之铭言：
: 想跟大家讨论一下
: 现在已经有很多的commercial enzyme、protein等等了
: 有一些早已行之有年的酵素
: 例如DNA polymerase I、DNA ligase等等
: 请问这些酵素能有办法查到他们在生物体内(ex.大肠杆菌)的总量
: 或浓度大约范围为何吗?
http://bionumbers.hms.harvard.edu/
哈佛大学开始把现有的文献整理 然後把这些数据放在这网站上面
有兴趣可以看这篇PAPER
http://www.pnas.org/content/early/2009/12/11/0907732106.short?rss=1
基本上，可以利用的方式像是
假设你养了一管Ecoli，只用glucose当它的营养来源
那它要分裂生长的时候，会发生什麽事情?
由数据可以知道需要两百万个glucose
但是细菌并不是只用glucose当作它的生长所需成分，它还需要蛋白质跟酯类
也就说它生长的能量需要多少?
由数据可以知道它需要四百万的ATP
而由生化数据知道一个glucose在有氧状态下可以产生30个ATP
也就说，那麽多的醣类被吸收後，有一大堆ATP都不是用在生长上?
那麽那些ATP到哪去了?
最大的猜测就是可能都被细胞膜上的蛋白质花掉了，
因为为了要保持内外某些离子的差异，这些需要耗掉ATP
Anyway 你可以试试这个网站
(以上文章是我翻译国外的部落格，如果有错，请跟我说)
: 而欲寻求这样的资料将会有些什麽盲点吗?
: 例如这些酵素是inducible的、
: 在生物体内才有对DNA有作用或有结合力的tendency等等
: 或者是这些资料根本不会公布?
: 这算是我之後可能会考虑做的实验方向
: 现在是怕如果可行性不高的话...
: 谢谢讨论:)
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◆ From: 128.119.52.172
1F：推 oplz:bionumber 还是太理想化了..实用性目前还是很低 04/02 07:03
2F：→ oplz:ron milo 已经回以色列去了 严格讲不能算是 HMS 的东西 04/02 07:03
3F：→ oplz:只是寄生在 HMS SysBio server 上而已. 04/02 07:04
4F：推 ararthur:谢谢你:D 04/02 12:59