作者aggaci (男的啦)
看板Biotech
标题Re: [求救] 请问EMSA使用的probe
时间Tue Feb 2 20:05:58 2010
※ 引述《deliciosa (I HOPE...)》之铭言：
: 请教大家一个有关EMSA的问题。
: 因为现在我必须要在动物组织中证明，某一个transcription factor(CREB)
: 与BDNF promoter有结合。所以想使用EMSA证明 (Panomics)。
: 但在询问产品专员的结果是还要另外请人合成一段biotin-labled
: BDNF promoter ds sequence。
: 那这样不就等於 只是证明CREB与BDNF promoter有(无)结合；但并非用来证实
: 在我的实验condition之下，CREB 的确有(无)与BDNF promoter结合。
ㄜ...我看不懂这两句话有什麽差别
: 所以现在是不是必须要自己设计primer，然後将tissue中的BNDF promoter sequece
: 放大并lable上biotin。
: 麻烦各位帮我解答，谢谢！
若不需要知道确切的结合位置
其实用CHIP就够了
用PCR放大？我没看过有人做EMSA的probe是用PCR放大的ㄝ
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◆ From: 122.121.207.32
1F：→ soom:PCR可加biotin-dUTP来做Labeling 02/03 13:38
2F：→ aggaci:这我当然知道，只是用那麽长的probe作EMSA我实在不知道这 02/03 15:12
3F：→ aggaci:CHIP差在哪？ 顶多CHIP是看整个promoter的差别而已 02/03 15:13
4F：→ aggaci:再说毕竟biotin-dUTP不=dTTP 会不会影响结合也不知道... 02/03 15:16